NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | item_count |
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51702 |
2k9j   |
16497 | cing | 2-parsed | STAR | dihedral angle | 150 |
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1 "Conversion project" NMR . parsed_2k9j 1
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_Entry.Sf_category entry_information
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_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
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_Entry.Origination .
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_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2k9j "Master copy" parsed_2k9j
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
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_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2k9j.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2k9j 1
1 2k9j.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 127 parsed_2k9j 1
1 2k9j.mr . . XPLOR/CNS 3 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 150 parsed_2k9j 1
1 2k9j.mr . . "MR format" 4 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2k9j 1
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_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_2k9j
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_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
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Chi1 empirical
W11 snorkel
;
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3
;
points NH toward extra, snorkeling
W12 snorkel
;
176 62 178 13 parsed_2k9j 1
4
;
points NH toward extra, snorkeling
M31
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(resid 31 and name CA)
(resid 31 and name CB)
(resid 31 and name CG) 1.00 -60.000 30.000 2
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(resid 31 and name CB)
(resid 31 and name CG)
(resid 31 and name SD) 1.00 180.000 30.000 2 ! this is the canonical RAMA value
assign (resid 31 and name CB)
(resid 31 and name CG)
(resid 31 and name SD)
(resid 31 and name CE) 1.00 +60.000 30.000 2 ! this is the canonical RAMA value
W32 snorkel
;
187 62 206 13 parsed_2k9j 1
5
;
points NH toward cytosol, snorkeling
Lys 33, snorkel
;
215 62 217 17 parsed_2k9j 1
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7 "Chi3 is adjusted to snorkel" 231 61 231 90 parsed_2k9j 1
8
;
this is the canonical RAMA value
F36 immerse
;
236 62 238 13 parsed_2k9j 1
9 F37 249 1 249 5 parsed_2k9j 1
10
;
R39-D139 H-bond
assign (resid 39 and name CZ)
(resid 39 and name NH1)
(resid 139 and name OD1)
(resid 139 and name CG) 1.00 0.000 30.000 2
assign (resid 39 and name CZ)
(resid 39 and name NH2)
(resid 139 and name OD2)
(resid 139 and name CG) 1.00 0.000 30.000 2
b3TM_dimer_talos_1sdtev.tbl
;
255 1 267 30 parsed_2k9j 1
11
;
empirical Chi
Asp, N-terminal, from Biophys J, 87, 3460-3469
;
425 1 427 48 parsed_2k9j 1
12 "this is the canonical RAMA value" 431 61 431 95 parsed_2k9j 1
13
;
this is the canonical RAMA value
Met, from Biophys J, 87, 3460-3469
-60,180,+60 is one good possibility out of three
;
436 61 440 51 parsed_2k9j 1
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15 "this is the canonical RAMA value" 449 61 449 95 parsed_2k9j 1
16
;
this is the canonical RAMA value
Trp, C-terminal, snorkeling, from Biophys J, 87, 3460-3469
;
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