NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
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515747 |
1xyd   |
5895 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 2468 |
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_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_1xyd
_Study_list.ID 1
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_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1xyd 1
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_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1xyd
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
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_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1xyd "Master copy" parsed_1xyd
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1xyd
_Constraint_stat_list.ID 1
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_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
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_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1xyd.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1xyd 1
1 1xyd.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 1856 parsed_1xyd 1
1 1xyd.mr . . XPLOR/CNS 3 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 49 parsed_1xyd 1
1 1xyd.mr . . XPLOR/CNS 4 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 49 parsed_1xyd 1
1 1xyd.mr . . XPLOR/CNS 5 distance "general distance" simple 28 parsed_1xyd 1
1 1xyd.mr . . XPLOR/CNS 6 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 306 parsed_1xyd 1
1 1xyd.mr . . XPLOR/CNS 7 distance "hydrogen bond" simple 180 parsed_1xyd 1
1 1xyd.mr . . XPLOR/CNS 8 "chemical shift" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1xyd 1
1 1xyd.mr . . "MR format" 9 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1xyd 1
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save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1xyd
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER METAL BINDING PROTEIN 09-NOV-04 1XYD
*TITLE NMR SOLUTION STRUCTURE OF RAT ZINC-CALCIUM-S100B, 20
*TITLE 2 STRUCTURES
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: S-100 PROTEIN, BETA CHAIN;
*COMPND 3 CHAIN: A, B;
*COMPND 4 SYNONYM: S100B;
*COMPND 5 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: RATTUS NORVEGICUS;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: RAT;
*SOURCE 4 GENE: S100B;
*SOURCE 5 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM_COMMON: BACTERIA;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN: HMS174(DE3);
*SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: PLASMID;
*SOURCE 9 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: PET11B
*KEYWDS METAL BINDING PROTEIN
*EXPDTA NMR, 20 STRUCTURES
*AUTHOR P.T.WILDER, K.M.VARNEY, D.J.WEBER
*REVDAT 1 07-JUN-05 1XYD 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1xyd
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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15 . . . . . . . . . . . . . . . . 1.82 . . . . sbt2 27 . n sbt2 27 . hn parsed_1xyd 2
16 . . . . . . . . . . . . . . . . -35.27 . . . . sbt2 28 . n sbt2 28 . hn parsed_1xyd 2
17 . . . . . . . . . . . . . . . . -26.15 . . . . sbt2 29 . n sbt2 29 . hn parsed_1xyd 2
18 . . . . . . . . . . . . . . . . -15.81 . . . . sbt2 30 . n sbt2 30 . hn parsed_1xyd 2
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28 . . . . . . . . . . . . . . . . 8.51 . . . . sbt2 49 . n sbt2 49 . hn parsed_1xyd 2
29 . . . . . . . . . . . . . . . . 31.62 . . . . sbt2 51 . n sbt2 51 . hn parsed_1xyd 2
30 . . . . . . . . . . . . . . . . -2.43 . . . . sbt2 52 . n sbt2 52 . hn parsed_1xyd 2
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32 . . . . . . . . . . . . . . . . 17.03 . . . . sbt2 56 . n sbt2 56 . hn parsed_1xyd 2
33 . . . . . . . . . . . . . . . . 34.66 . . . . sbt2 61 . n sbt2 61 . hn parsed_1xyd 2
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35 . . . . . . . . . . . . . . . . -9.73 . . . . sbt2 68 . n sbt2 68 . hn parsed_1xyd 2
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43 . . . . . . . . . . . . . . . . -7.91 . . . . sbt2 78 . n sbt2 78 . hn parsed_1xyd 2
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49 . . . . . . . . . . . . . . . . -7.91 . . . . sbt2 91 . n sbt2 91 . hn parsed_1xyd 2
stop_
loop_
_RDC_constraint_comment_org.ID
_RDC_constraint_comment_org.Comment_text
_RDC_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_RDC_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_RDC_constraint_comment_org.Comment_end_line
_RDC_constraint_comment_org.Comment_end_column
_RDC_constraint_comment_org.Entry_ID
_RDC_constraint_comment_org.RDC_constraint_list_ID
1
;
stretched gel
hn and segid="sbt2" dipolar data
;
1 1 2 34 parsed_1xyd 2
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_5
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1xyd
_Distance_constraint_list.ID 2
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_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
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_Dist_constraint_tree.Logic_operation
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_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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2 1 . . . parsed_1xyd 2
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5 1 . . . parsed_1xyd 2
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stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
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_Dist_constraint.Entity_ID
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6 1 2 . . . . . . . . sbt2 26 . o parsed_1xyd 2
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9 1 2 . . . . . . . . sbt1 61 . od# parsed_1xyd 2
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10 1 2 . . . . . . . . sbt2 61 . od# parsed_1xyd 2
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11 1 2 . . . . . . . . sbt1 63 . od# parsed_1xyd 2
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12 1 2 . . . . . . . . sbt2 63 . od# parsed_1xyd 2
13 1 1 . . . . . . . . cat1 1 . mca parsed_1xyd 2
13 1 2 . . . . . . . . sbt1 65 . od# parsed_1xyd 2
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16 1 2 . . . . . . . . sbt2 67 . o parsed_1xyd 2
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18 1 2 . . . . . . . . sbt2 72 . oe1 parsed_1xyd 2
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19 1 2 . . . . . . . . sbt1 72 . oe2 parsed_1xyd 2
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20 1 2 . . . . . . . . sbt2 72 . oe2 parsed_1xyd 2
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28 1 2 . . . . . . . . sbt1 89 . oe# parsed_1xyd 2
stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
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_Dist_constraint_value.Entry_ID
_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
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2 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
3 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
4 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
5 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
6 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
7 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
8 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
9 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
10 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
11 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
12 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
13 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
14 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
15 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
16 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
17 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
18 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
19 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
20 1 . . . . . 2.4 2.0 2.8 parsed_1xyd 2
21 1 . . . . . 2.0 2.0 2.0 parsed_1xyd 2
22 1 . . . . . 2.0 2.0 2.0 parsed_1xyd 2
23 1 . . . . . 2.0 2.0 2.0 parsed_1xyd 2
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25 1 . . . . . 2.0 2.0 2.0 parsed_1xyd 2
26 1 . . . . . 2.0 2.0 2.0 parsed_1xyd 2
27 1 . . . . . 2.04 2.04 2.04 parsed_1xyd 2
28 1 . . . . . 2.04 2.04 2.04 parsed_1xyd 2
stop_
loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
_Dist_constraint_comment_org.Comment_text
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
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save_
save_CNS/XPLOR_dihedral_6
_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_1xyd
_Torsion_angle_constraint_list.ID 1
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_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 6
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
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_Torsion_angle_constraint.ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_name
_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_1
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_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Entity_assembly_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Comp_index_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Seq_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Comp_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Atom_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Entity_assembly_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Comp_index_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Seq_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Comp_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Atom_ID_4
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_Torsion_angle_constraint.Source_experiment_ID
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_Torsion_angle_constraint.Entry_ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_constraint_list_ID
1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -78.60 -38.60 . sbt1 1 . c sbt1 2 . n sbt1 2 . ca sbt1 2 . c parsed_1xyd 1
2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -78.60 -38.60 . sbt2 1 . c sbt2 2 . n sbt2 2 . ca sbt2 2 . c parsed_1xyd 1
3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -49.0 -19.0 . sbt1 2 . n sbt1 2 . ca sbt1 2 . c sbt1 3 . n parsed_1xyd 1
4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -49.0 -19.0 . sbt2 2 . n sbt2 2 . ca sbt2 2 . c sbt2 3 . n parsed_1xyd 1
5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -88.10 -48.10 . sbt1 2 . c sbt1 3 . n sbt1 3 . ca sbt1 3 . c parsed_1xyd 1
6 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -88.10 -48.10 . sbt2 2 . c sbt2 3 . n sbt2 3 . ca sbt2 3 . c parsed_1xyd 1
7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -82.40 -42.40 . sbt1 3 . c sbt1 4 . n sbt1 4 . ca sbt1 4 . c parsed_1xyd 1
8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -82.40 -42.40 . sbt2 3 . c sbt2 4 . n sbt2 4 . ca sbt2 4 . c parsed_1xyd 1
9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -82.00 -42.00 . sbt1 4 . c sbt1 5 . n sbt1 5 . ca sbt1 5 . c parsed_1xyd 1
10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -82.00 -42.00 . sbt2 4 . c sbt2 5 . n sbt2 5 . ca sbt2 5 . c parsed_1xyd 1
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loop_
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1
;
Dihedral angles
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E2 phi
;
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26 "H15 psi" 257 1 257 9 parsed_1xyd 1
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30 "Y17 psi" 297 1 297 9 parsed_1xyd 1
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35 "R20 psi" 347 1 347 9 parsed_1xyd 1
36
;
End Helix 1
E21 phi
;
357 1 359 9 parsed_1xyd 1
37 "E21 psi" 369 1 369 9 parsed_1xyd 1
38
;
Start Beta Sheet 1
K26 phi
;
379 1 381 9 parsed_1xyd 1
39 "K26 psi" 391 1 391 9 parsed_1xyd 1
40 "L27 phi" 401 1 401 9 parsed_1xyd 1
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43 "K28 psi" 431 1 431 9 parsed_1xyd 1
44
;
End Beta Sheet 1
Start Helix 2
K29 phi
;
441 1 444 9 parsed_1xyd 1
45 "K29 psi" 454 1 454 9 parsed_1xyd 1
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60 "N37 psi" 604 1 604 9 parsed_1xyd 1
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63
;
End Helix 2
Start Flexible Hinge Loop
E39 phi
;
634 1 637 9 parsed_1xyd 1
64 "L40 phi" 647 1 647 9 parsed_1xyd 1
65 "S41 psi" 657 1 657 9 parsed_1xyd 1
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78
;
End Flexible Hinge Loop
Start Helix 3
E51 phi
;
787 1 790 9 parsed_1xyd 1
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97
;
End Helix 3
Start True EF-hand Loop
D61 phi
;
980 1 983 9 parsed_1xyd 1
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108 "G66 psi" 1093 1 1093 9 parsed_1xyd 1
109
;
Start Beta strand 2
E67 phi
;
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114
;
End Beta Sheet 2
Start Helix 4
F70 phi
;
1155 1 1158 9 parsed_1xyd 1
115 "F70 psi" 1168 1 1168 9 parsed_1xyd 1
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loop_
_TA_constraint_parse_err.ID
_TA_constraint_parse_err.Content
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_TA_constraint_parse_err.Begin_column
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_Distance_constraint_list.Block_ID 7
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
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_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
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