NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | item_count |
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49163 |
2jr4   |
15319 | cing | 2-parsed | STAR | dihedral angle | 119 |
data_2jr4_MR_file_constraints
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1 "Conversion project" NMR . parsed_2jr4 1
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_Entry.Sf_category entry_information
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_Entry.Version_type original
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loop_
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_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2jr4 "Master copy" parsed_2jr4
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2jr4
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1 2jr4.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2jr4 1
1 2jr4.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 562 parsed_2jr4 1
1 2jr4.mr . . XPLOR/CNS 3 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 119 parsed_2jr4 1
1 2jr4.mr . . "MR format" 4 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2jr4 1
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_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_2jr4
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_Torsion_angle_constraint.Entry_ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_constraint_list_ID
1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -51.1 -21.1 . . 32 . O4' . 32 . C4' . 32 . C3' . 32 . C2' parsed_2jr4 1
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4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -51.1 -21.1 . . 33 . O4' . 33 . C4' . 33 . C3' . 33 . C2' parsed_2jr4 1
5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22.3 52.3 . . 33 . C4' . 33 . C3' . 33 . C2' . 33 . C1' parsed_2jr4 1
6 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -40.8 -10.8 . . 33 . C3' . 33 . C2' . 33 . C1' . 33 . O4' parsed_2jr4 1
7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -51.1 -21.1 . . 38 . O4' . 38 . C4' . 38 . C3' . 38 . C2' parsed_2jr4 1
8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22.3 52.3 . . 38 . C4' . 38 . C3' . 38 . C2' . 38 . C1' parsed_2jr4 1
9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -40.8 -10.8 . . 38 . C3' . 38 . C2' . 38 . C1' . 38 . O4' parsed_2jr4 1
10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -98.0 -38.0 . . 31 . O3' . 32 . P . 32 . O5' . 32 . C5' parsed_2jr4 1
11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -98.0 -38.0 . . 32 . O3' . 33 . P . 33 . O5' . 33 . C5' parsed_2jr4 1
12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -98.0 -38.0 . . 33 . O3' . 34 . P . 34 . O5' . 34 . C5' parsed_2jr4 1
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14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148.0 208.0 . . 32 . P . 32 . O5' . 32 . C5' . 32 . C4' parsed_2jr4 1
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76 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -66 -6 . . 41 . C2' . 41 . C3' . 41 . C4' . 41 . O4' parsed_2jr4 1
77 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -9 51 . . 41 . C3' . 41 . C4' . 41 . O4' . 41 . C1' parsed_2jr4 1
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79 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -55 5 . . 42 . O4' . 42 . C1' . 42 . C2' . 42 . C3' parsed_2jr4 1
80 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 67 . . 42 . C1' . 42 . C2' . 42 . C3' . 42 . C4' parsed_2jr4 1
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stop_
loop_
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1
;
---------------------------------------------------------------------
Torsion Angle restraints
----------------------------------------------------------------------
;
1 1 3 72 parsed_2jr4 1
2
;
Loop
CYT 32 C3' endo
;
5 4 7 80 parsed_2jr4 1
3 "CYT 33 C3' endo" 24 1 25 81 parsed_2jr4 1
4
;
URI 34 Unrestrained
ADE 35 Unrestrained
CYT 36 Unrestrained
ADE 37 Unrestrained
ADE 38 C3' endo
;
41 1 51 81 parsed_2jr4 1
5
;
alpha: O3'-P-O5'-C5'
CYT 32
;
68 1 70 8 parsed_2jr4 1
6 "URI 33 left" 77 1 77 14 parsed_2jr4 1
7 "URI 34" 83 1 83 8 parsed_2jr4 1
8
;
ADE 35 Unrestrained
CYT 36 Unrestrained
ADE 37 Unrestrained
ADE 38
;
89 1 95 8 parsed_2jr4 1
9
;
beta: P-O5'-C5'-C4'
CYT 32
;
102 1 104 9 parsed_2jr4 1
10 "URI 33" 110 1 110 9 parsed_2jr4 1
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14 "ADE 37" 135 1 135 8 parsed_2jr4 1
15
;
ADE 38 Unrestrained
Xhi Purines = O4'-C1'-N9-C4
Pyrimidines = O4'-C1'-N1-C2
C32
;
142 1 148 5 parsed_2jr4 1
16 U33 154 1 154 5 parsed_2jr4 1
17 U34 160 1 160 5 parsed_2jr4 1
18 A35 166 1 166 5 parsed_2jr4 1
19 C36 172 1 172 5 parsed_2jr4 1
20 A37 178 1 178 5 parsed_2jr4 1
21 A38 183 1 183 5 parsed_2jr4 1
22
;
Epsilon: C4'-C3'-O3'-P
C32 (trans)
;
189 1 192 81 parsed_2jr4 1
23 "U33 (trans)" 198 1 199 81 parsed_2jr4 1
24 U34 205 1 205 83 parsed_2jr4 1
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27 "A37 (trans)" 227 1 228 81 parsed_2jr4 1
28 "A38 (trans)" 234 1 235 81 parsed_2jr4 1
29
;
Zeta : C3'-O3'-P-O5'
CYT 32
;
242 1 244 9 parsed_2jr4 1
30
;
URI 33 left unrestrained
URI 34 left unrestrained
ADE 35
;
250 1 255 8 parsed_2jr4 1
31 "CYT 36" 261 1 261 8 parsed_2jr4 1
32
;
ADE 37 left unrestrained
ADE 38
;
267 1 270 8 parsed_2jr4 1
33
;
---------------------------------------------
Stem
CYT 27 C3' endo
nu0
;
276 1 282 5 parsed_2jr4 1
34 nu1 289 1 289 5 parsed_2jr4 1
35 nu2 296 1 296 5 parsed_2jr4 1
36 nu3 303 1 303 5 parsed_2jr4 1
37 nu4 309 1 309 5 parsed_2jr4 1
38
;
CYT 28 C3' endo
nu0
;
318 1 319 5 parsed_2jr4 1
39 nu1 326 1 326 5 parsed_2jr4 1
40 nu2 333 1 333 5 parsed_2jr4 1
41 nu3 340 1 340 5 parsed_2jr4 1
42 nu4 346 1 346 5 parsed_2jr4 1
43
;
URI 29 C3' endo
nu0
;
352 1 353 5 parsed_2jr4 1
44 nu1 360 1 360 5 parsed_2jr4 1
45 nu2 367 1 367 5 parsed_2jr4 1
46 nu3 374 1 374 5 parsed_2jr4 1
47 nu4 380 1 380 5 parsed_2jr4 1
48
;
CYT 30 C3' endo
nu0
;
386 1 387 5 parsed_2jr4 1
49 nu1 394 1 394 5 parsed_2jr4 1
50 nu2 401 1 401 5 parsed_2jr4 1
51 nu3 408 1 408 5 parsed_2jr4 1
52 nu4 414 1 414 5 parsed_2jr4 1
53
;
CYT 31 C3' endo
nu0
;
420 1 421 5 parsed_2jr4 1
54 nu1 428 1 428 5 parsed_2jr4 1
55 nu2 435 1 435 5 parsed_2jr4 1
56 nu3 442 1 442 5 parsed_2jr4 1
57 nu4 448 1 448 5 parsed_2jr4 1
58
;
GUA 39 C3'endo
nu0
;
454 2 455 5 parsed_2jr4 1
59 nu1 462 1 462 5 parsed_2jr4 1
60 nu2 469 1 469 5 parsed_2jr4 1
61 nu3 476 1 476 5 parsed_2jr4 1
62 nu4 482 1 482 5 parsed_2jr4 1
63
;
G40 C3' endo
nu0
;
489 1 490 5 parsed_2jr4 1
64 nu1 497 1 497 5 parsed_2jr4 1
65 nu2 504 1 504 5 parsed_2jr4 1
66 nu3 511 1 511 5 parsed_2jr4 1
67 nu4 517 1 517 5 parsed_2jr4 1
68
;
ADE 41 C3'endo
nu0
;
523 1 524 5 parsed_2jr4 1
69 nu1 531 1 531 5 parsed_2jr4 1
70 nu2 538 1 538 5 parsed_2jr4 1
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72 nu4 551 1 551 5 parsed_2jr4 1
73
;
GUA 42 C3'endo
nu0
;
557 1 558 5 parsed_2jr4 1
74 nu1 565 1 565 5 parsed_2jr4 1
75 nu2 572 1 572 5 parsed_2jr4 1
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78
;
GUA 43 C2'endo
alpha: O3'-P-O5'-C5'
CYT 27 left unconstrained no 5' phosphate for this residue********
CYT 28
;
591 1 597 8 parsed_2jr4 1
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85 "GUA 42" 639 1 639 8 parsed_2jr4 1
86 "GUA 43" 645 1 645 8 parsed_2jr4 1
87
;
beta: P-O5'-C5'-C4'
CYT 27 no 5' Phosphate
CYT 28
;
652 1 656 8 parsed_2jr4 1
88 "URI 29" 662 1 662 8 parsed_2jr4 1
89 "CYT 30" 668 1 668 8 parsed_2jr4 1
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95 "GUA 43" 705 1 705 8 parsed_2jr4 1
96
;
Xhi Purines = O4'-C1'-N9-C4
Pyrimidines = O4'-C1'-N1-C2
C27
;
712 1 715 5 parsed_2jr4 1
97 C28 721 1 721 5 parsed_2jr4 1
98 U29 726 1 726 5 parsed_2jr4 1
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102 G40 750 1 750 5 parsed_2jr4 1
103 A41 756 1 756 5 parsed_2jr4 1
104 G42 762 1 762 5 parsed_2jr4 1
105 G43 768 1 768 5 parsed_2jr4 1
106
;
Epsilon: C4'-C3'-O3'-P
C27 (trans)
;
774 1 777 81 parsed_2jr4 1
107 "C28 (trans)" 783 1 784 81 parsed_2jr4 1
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