NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
481069 | 1mdi | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1mdi save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 2040 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 97 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 8.571 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.253 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0231 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0042 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0884 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 1 MET 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 2 VAL 0.056 0.056 1 0 "[ ]" 1 3 LYS 0.105 0.105 1 0 "[ ]" 1 4 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 5 ILE 0.303 0.191 1 0 "[ ]" 1 6 GLU 0.191 0.191 1 0 "[ ]" 1 7 SER 0.042 0.042 1 0 "[ ]" 1 8 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 9 THR 0.065 0.065 1 0 "[ ]" 1 10 ALA 0.502 0.196 1 0 "[ ]" 1 11 PHE 0.140 0.107 1 0 "[ ]" 1 12 GLN 0.063 0.063 1 0 "[ ]" 1 13 GLU 0.408 0.196 1 0 "[ ]" 1 14 ALA 0.254 0.107 1 0 "[ ]" 1 15 LEU 0.335 0.177 1 0 "[ ]" 1 16 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 17 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 18 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 19 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 20 ASP 0.193 0.193 1 0 "[ ]" 1 21 LYS 0.019 0.019 1 0 "[ ]" 1 22 LEU 0.379 0.199 1 0 "[ ]" 1 23 VAL 0.006 0.006 1 0 "[ ]" 1 24 VAL 0.687 0.160 1 0 "[ ]" 1 25 VAL 0.379 0.204 1 0 "[ ]" 1 26 ASP 0.112 0.068 1 0 "[ ]" 1 27 PHE 0.183 0.099 1 0 "[ ]" 1 28 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 29 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 30 THR 0.102 0.057 1 0 "[ ]" 1 31 TRP 0.232 0.165 1 0 "[ ]" 1 32 CYS 0.165 0.165 1 0 "[ ]" 1 33 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 34 PRO 0.152 0.152 1 0 "[ ]" 1 35 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 36 LYS 0.189 0.189 1 0 "[ ]" 1 37 MET 0.234 0.152 1 0 "[ ]" 1 38 ILE 0.189 0.189 1 0 "[ ]" 1 39 LYS 0.135 0.082 1 0 "[ ]" 1 40 PRO 0.037 0.037 1 0 "[ ]" 1 41 PHE 0.181 0.067 1 0 "[ ]" 1 42 PHE 0.102 0.034 1 0 "[ ]" 1 43 HIS 0.171 0.135 1 0 "[ ]" 1 44 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 45 LEU 0.350 0.135 1 0 "[ ]" 1 46 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 47 GLU 0.094 0.094 1 0 "[ ]" 1 48 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 49 TYR 0.208 0.099 1 0 "[ ]" 1 50 SER 0.086 0.086 1 0 "[ ]" 1 51 ASN 0.238 0.087 1 0 "[ ]" 1 52 VAL 0.029 0.029 1 0 "[ ]" 1 53 ILE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 54 PHE 0.383 0.141 1 0 "[ ]" 1 55 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 56 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 57 VAL 0.272 0.204 1 0 "[ ]" 1 58 ASP 0.128 0.083 1 0 "[ ]" 1 59 VAL 0.057 0.057 1 0 "[ ]" 1 60 ASP 0.083 0.083 1 0 "[ ]" 1 61 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 62 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 63 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 64 ASP 0.182 0.089 1 0 "[ ]" 1 65 VAL 0.012 0.012 1 0 "[ ]" 1 66 ALA 0.062 0.062 1 0 "[ ]" 1 67 SER 0.052 0.052 1 0 "[ ]" 1 68 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 69 ALA 0.012 0.012 1 0 "[ ]" 1 70 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 71 VAL 0.303 0.190 1 0 "[ ]" 1 72 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 73 ALA 0.190 0.190 1 0 "[ ]" 1 74 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 75 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 76 THR 0.438 0.253 1 0 "[ ]" 1 77 PHE 0.804 0.165 1 0 "[ ]" 1 78 GLN 0.380 0.253 1 0 "[ ]" 1 79 PHE 0.763 0.241 1 0 "[ ]" 1 80 PHE 0.099 0.099 1 0 "[ ]" 1 81 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 82 LYS 0.614 0.244 1 0 "[ ]" 1 83 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 84 GLN 0.244 0.244 1 0 "[ ]" 1 85 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 86 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 87 GLY 0.039 0.039 1 0 "[ ]" 1 88 GLU 0.395 0.200 1 0 "[ ]" 1 89 PHE 0.935 0.241 1 0 "[ ]" 1 90 SER 0.071 0.060 1 0 "[ ]" 1 91 GLY 0.083 0.083 1 0 "[ ]" 1 92 ALA 0.165 0.165 1 0 "[ ]" 1 93 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 94 LYS 0.195 0.108 1 0 "[ ]" 1 95 GLU 0.108 0.108 1 0 "[ ]" 1 96 LYS 0.231 0.231 1 0 "[ ]" 1 97 LEU 0.321 0.108 1 0 "[ ]" 1 98 GLU 0.410 0.231 1 0 "[ ]" 1 99 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 100 THR 0.047 0.038 1 0 "[ ]" 1 101 ILE 0.420 0.138 1 0 "[ ]" 1 102 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 103 GLU 0.151 0.085 1 0 "[ ]" 1 104 LEU 0.186 0.156 1 0 "[ ]" 1 105 VAL 0.030 0.030 1 0 "[ ]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 3 LYS H 1 3 LYS QG 4.000 . 6.000 4.157 4.157 4.157 . 0 0 "[ ]" 1 2 1 3 LYS H 1 3 LYS HB2 3.000 . 3.500 3.334 3.334 3.334 . 0 0 "[ ]" 1 3 1 5 ILE H 1 5 ILE HB 2.500 . 2.900 2.624 2.624 2.624 . 0 0 "[ ]" 1 4 1 5 ILE H 1 5 ILE QG 4.000 . 6.000 2.296 2.296 2.296 . 0 0 "[ ]" 1 5 1 5 ILE H 1 5 ILE MD 4.000 . 6.500 3.071 3.071 3.071 . 0 0 "[ ]" 1 6 1 6 GLU H 1 6 GLU HB2 3.000 . 3.500 2.650 2.650 2.650 . 0 0 "[ ]" 1 7 1 7 SER H 1 7 SER HB2 4.000 . 5.000 3.945 3.945 3.945 . 0 0 "[ ]" 1 8 1 8 LYS H 1 8 LYS QB 2.500 . 3.500 2.197 2.197 2.197 . 0 0 "[ ]" 1 9 1 8 LYS H 1 8 LYS HA 3.000 . 3.500 2.802 2.802 2.802 . 0 0 "[ ]" 1 10 1 9 THR H 1 9 THR MG 4.000 . 6.500 3.767 3.767 3.767 . 0 0 "[ ]" 1 11 1 9 THR H 1 9 THR HA 2.500 . 2.900 2.851 2.851 2.851 . 0 0 "[ ]" 1 12 1 10 ALA H 1 10 ALA MB 2.500 . 4.000 2.085 2.085 2.085 . 0 0 "[ ]" 1 13 1 10 ALA H 1 10 ALA HA 2.500 . 2.900 2.889 2.889 2.889 . 0 0 "[ ]" 1 14 1 11 PHE H 1 11 PHE HB3 3.000 . 3.500 2.553 2.553 2.553 . 0 0 "[ ]" 1 15 1 11 PHE H 1 11 PHE HB2 2.500 . 2.900 2.612 2.612 2.612 . 0 0 "[ ]" 1 16 1 11 PHE H 1 11 PHE HA 3.000 . 3.500 2.849 2.849 2.849 . 0 0 "[ ]" 1 17 1 12 GLN HA 1 12 GLN QE 4.000 . 6.000 3.911 3.911 3.911 . 0 0 "[ ]" 1 18 1 12 GLN H 1 12 GLN HA 3.000 . 3.500 2.816 2.816 2.816 . 0 0 "[ ]" 1 19 1 12 GLN H 1 12 GLN QB 2.500 . 3.500 2.687 2.687 2.687 . 0 0 "[ ]" 1 20 1 13 GLU H 1 13 GLU QG 4.000 . 4.500 2.415 2.415 2.415 . 0 0 "[ ]" 1 21 1 13 GLU H 1 13 GLU HA 2.500 . 2.900 2.835 2.835 2.835 . 0 0 "[ ]" 1 22 1 13 GLU H 1 13 GLU HB2 2.500 . 2.900 2.416 2.416 2.416 . 0 0 "[ ]" 1 23 1 13 GLU H 1 13 GLU HB3 3.000 . 3.500 3.602 3.602 3.602 0.102 1 0 "[ ]" 1 24 1 14 ALA H 1 14 ALA MB 2.500 . 4.000 2.249 2.249 2.249 . 0 0 "[ ]" 1 25 1 15 LEU H 1 15 LEU MD2 4.000 . 6.500 2.549 2.549 2.549 . 0 0 "[ ]" 1 26 1 15 LEU H 1 15 LEU HB2 3.000 . 3.500 2.790 2.790 2.790 . 0 0 "[ ]" 1 27 1 15 LEU H 1 15 LEU HA 3.000 . 3.500 2.876 2.876 2.876 . 0 0 "[ ]" 1 28 1 15 LEU H 1 15 LEU MD1 4.000 . 6.500 3.520 3.520 3.520 . 0 0 "[ ]" 1 29 1 15 LEU H 1 15 LEU HG 2.500 . 2.900 1.767 1.767 1.767 0.033 1 0 "[ ]" 1 30 1 16 ASP H 1 16 ASP HA 3.000 . 3.500 2.863 2.863 2.863 . 0 0 "[ ]" 1 31 1 16 ASP H 1 16 ASP QB 2.500 . 3.500 2.274 2.274 2.274 . 0 0 "[ ]" 1 32 1 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