NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
468811 | 2a7u | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_2a7u save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 1195 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 93 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 27.717 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 1.459 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.1116 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0232 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.2980 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 2 2 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 3 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 4 ILE 2.049 0.787 1 1 [+] 2 5 THR 1.021 0.706 1 1 [+] 2 6 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 7 ALA 0.055 0.055 1 0 "[ ]" 2 8 ARG 2.248 0.787 1 1 [+] 2 9 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 10 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 11 ALA 0.143 0.143 1 0 "[ ]" 2 12 LYS 0.063 0.063 1 0 "[ ]" 2 13 ALA 0.822 0.443 1 0 "[ ]" 2 14 ALA 0.357 0.163 1 0 "[ ]" 2 15 PHE 0.236 0.143 1 0 "[ ]" 2 16 ASP 0.469 0.239 1 0 "[ ]" 2 17 PHE 1.386 0.443 1 0 "[ ]" 2 18 ALA 0.319 0.228 1 0 "[ ]" 2 19 VAL 0.016 0.016 1 0 "[ ]" 2 20 GLU 0.421 0.239 1 0 "[ ]" 2 21 HIS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 22 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 23 SER 1.122 0.917 1 1 [+] 2 24 VAL 0.514 0.265 1 0 "[ ]" 2 25 GLU 1.687 0.847 1 1 [+] 2 26 ARG 0.802 0.302 1 0 "[ ]" 2 27 TRP 1.285 0.917 1 1 [+] 2 28 GLN 1.092 1.092 1 1 [+] 2 29 ASP 1.687 0.847 1 1 [+] 2 30 MET 0.701 0.302 1 0 "[ ]" 2 31 LEU 1.092 1.092 1 1 [+] 2 32 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 33 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 34 ALA 0.000 0.000 1 0 "[ ]" 2 35 ALA 0.284 0.242 1 0 "[ ]" 2 36 GLU 0.401 0.242 1 0 "[ ]" 2 37 VAL 0.010 0.010 1 0 "[ ]" 2 38 THR 0.110 0.110 1 0 "[ ]" 2 39 LYS 0.117 0.117 1 0 "[ ]" 2 40 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 41 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 42 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 43 MET 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 44 ALA 0.088 0.088 1 0 "[ ]" 2 45 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 46 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 47 LEU 1.023 0.798 1 1 [+] 2 48 SER 0.798 0.798 1 1 [+] 2 49 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 50 ALA 0.509 0.446 1 0 "[ ]" 2 51 LEU 0.914 0.468 1 0 "[ ]" 2 52 ALA 0.531 0.468 1 0 "[ ]" 2 53 PRO 0.812 0.314 1 0 "[ ]" 2 54 GLU 0.498 0.314 1 0 "[ ]" 2 55 THR 2.969 0.975 1 1 [+] 2 56 LEU 1.208 0.524 1 1 [+] 2 57 ALA 1.065 0.498 1 0 "[ ]" 2 58 GLU 1.978 0.975 1 1 [+] 2 59 SER 1.263 0.664 1 1 [+] 2 60 PHE 2.068 1.459 1 1 [+] 2 61 ILE 3.365 1.459 1 1 [+] 2 62 ALA 1.049 0.684 1 1 [+] 2 63 VAL 1.076 0.513 1 1 [+] 2 64 CYS 0.258 0.198 1 0 "[ ]" 2 65 GLY 0.563 0.513 1 1 [+] 2 66 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 67 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 68 LEU 0.696 0.375 1 0 "[ ]" 2 69 ASP 1.062 0.375 1 0 "[ ]" 2 70 GLU 0.054 0.054 1 0 "[ ]" 2 71 ASN 0.164 0.164 1 0 "[ ]" 2 72 GLY 0.550 0.365 1 0 "[ ]" 2 73 GLN 0.027 0.027 1 0 "[ ]" 2 74 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 75 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 76 ILE 0.047 0.047 1 0 "[ ]" 2 77 ARG 0.027 0.027 1 0 "[ ]" 2 78 VAL 0.299 0.299 1 0 "[ ]" 2 79 MET 0.299 0.299 1 0 "[ ]" 2 80 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 81 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 82 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 83 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 84 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 85 LEU 1.411 0.436 1 0 "[ ]" 2 86 ASN 0.525 0.436 1 0 "[ ]" 2 87 ALA 0.036 0.036 1 0 "[ ]" 2 88 LEU 0.621 0.398 1 0 "[ ]" 2 89 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 90 ASP 1.260 0.632 1 1 [+] 2 91 VAL 0.279 0.126 1 0 "[ ]" 2 92 LEU 0.348 0.222 1 0 "[ ]" 2 93 GLU 0.162 0.100 1 0 "[ ]" 2 94 GLN 1.451 0.632 1 1 [+] 2 95 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 96 ILE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 97 HIS 0.162 0.100 1 0 "[ ]" 2 98 LEU 0.399 0.243 1 0 "[ ]" 2 99 ARG 0.232 0.232 1 0 "[ ]" 2 100 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 101 VAL 0.316 0.316 1 0 "[ ]" 2 102 SER 0.316 0.316 1 0 "[ ]" 2 103 GLU 0.193 0.193 1 0 "[ ]" 2 104 ALA 0.193 0.193 1 0 "[ ]" 2 105 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 2 3 PHE H 2 3 PHE QD 1.800 . 5.000 3.010 3.010 3.010 . 0 0 "[ ]" 1 2 2 4 ILE H 2 4 ILE HB 1.800 . 4.000 3.572 3.572 3.572 . 0 0 "[ ]" 1 3 2 4 ILE H 2 4 ILE HG13 1.800 . 4.000 2.112 2.112 2.112 . 0 0 "[ ]" 1 4 2 4 ILE H 2 4 ILE HG12 1.800 . 4.500 2.881 2.881 2.881 . 0 0 "[ ]" 1 5 2 4 ILE H 2 4 ILE MG 1.800 . 4.500 2.232 2.232 2.232 . 0 0 "[ ]" 1 6 2 4 ILE H 2 4 ILE MD 1.800 . 4.500 3.727 3.727 3.727 . 0 0 "[ ]" 1 7 2 5 THR H 2 5 THR HB 1.800 . 4.000 2.476 2.476 2.476 . 0 0 "[ ]" 1 8 2 5 THR H 2 5 THR MG 1.800 . 4.500 3.705 3.705 3.705 . 0 0 "[ ]" 1 9 2 6 VAL H 2 6 VAL HB 1.800 . 4.000 2.130 2.130 2.130 . 0 0 "[ ]" 1 10 2 6 VAL H 2 6 VAL MG1 1.800 . 4.500 2.561 2.561 2.561 . 0 0 "[ ]" 1 11 2 6 VAL H 2 6 VAL MG2 1.800 . 4.500 3.608 3.608 3.608 . 0 0 "[ ]" 1 12 2 6 VAL HA 2 6 VAL MG1 1.800 . 3.500 3.167 3.167 3.167 . 0 0 "[ ]" 1 13 2 6 VAL HA 2 6 VAL MG2 1.800 . 3.500 2.222 2.222 2.222 . 0 0 "[ ]" 1 14 2 7 ALA H 2 7 ALA MB 1.800 . 4.500 2.018 2.018 2.018 . 0 0 "[ ]" 1 15 2 8 ARG H 2 8 ARG QG 1.800 . 4.500 3.609 3.609 3.609 . 0 0 "[ ]" 1 16 2 8 ARG H 2 8 ARG QD 1.800 . 5.000 4.218 4.218 4.218 . 0 0 "[ ]" 1 17 2 8 ARG HA 2 8 ARG QD 1.800 . 5.000 3.944 3.944 3.944 . 0 0 "[ ]" 1 18 2 11 ALA H 2 11 ALA MB 1.800 . 4.500 2.150 2.150 2.150 . 0 0 "[ ]" 1 19 2 13 ALA H 2 13 ALA MB 1.800 . 4.500 2.004 2.004 2.004 . 0 0 "[ ]" 1 20 2 14 ALA H 2 14 ALA MB 1.800 . 4.500 2.109 2.109 2.109 . 0 0 "[ ]" 1 21 2 15 PHE H 2 15 PHE QD 1.800 . 4.500 4.119 4.119 4.119 . 0 0 "[ ]" 1 22 2 17 PHE H 2 17 PHE QD 1.800 . 4.500 2.543 2.543 2.543 . 0 0 "[ ]" 1 23 2 18 ALA H 2 18 ALA MB 1.800 . 4.500 2.170 2.170 2.170 . 0 0 "[ ]" 1 24 2 19 VAL H 2 19 VAL HB 1.800 . 4.000 2.300 2.300 2.300 . 0 0 "[ ]" 1 25 2 19 VAL H 2 19 VAL MG1 1.800 . 4.500 3.702 3.702 3.702 . 0 0 "[ ]" 1 26 2 19 VAL H 2 19 VAL MG2 1.800 . 4.000 2.233 2.233 2.233 . 0 0 "[ ]" 1 27 2 20 GLU H 2 20 GLU QG 1.800 . 4.500 3.511 3.511 3.511 . 0 0 "[ ]" 1 28 2 21 HIS H 2 21 HIS HB2 1.800 . 4.000 2.369 2.369 2.369 . 0 0 "[ ]" 1 29 2 22 GLN H 2 22 GLN QG 1.800 . 4.500 3.646 3.646 3.646 . 0 0 "[ ]" 1 30 2 24 VAL H 2 24 VAL HB 1.800 . 4.000 2.378 2.378 2.378 . 0 0 "[ ]" 1 31 2 24 VAL H 2 24 VAL QG 1.800 . 4.500 2.182 2.182 2.182 . 0 0 "[ ]" 1 32 2 25 GLU H 2 25 GLU QG 1.800 . 4.500 2.026 2.026 2.026 . 0 0 "[ ]" 1 33 2 26 ARG H 2 26 ARG QG 1.800 . 4.500 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