NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
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45660 |
2edd   |
11097 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 2440 |
data_2edd_MR_file_constraints
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_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2edd
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2edd 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2edd
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2edd "Master copy" parsed_2edd
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2edd
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2edd.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2edd 1
1 2edd.mr . . DYANA/DIANA 2 distance NOE simple 2372 parsed_2edd 1
1 2edd.mr . . DYANA/DIANA 3 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 66 parsed_2edd 1
1 2edd.mr . . DYANA/DIANA 4 distance NOE simple 2 parsed_2edd 1
1 2edd.mr . . "MR format" 5 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2edd 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_2edd
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER APOPTOSIS 14-FEB-07 2EDD
*TITLE SOLUTION STRUCTURE OF THE FIFTH FIBRONECTIN TYPE III DOMAIN
*TITLE 2 OF HUMAN NETRIN RECEPTOR DCC
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: NETRIN RECEPTOR DCC;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 FRAGMENT: FIFTH FN3 DOMAIN;
*COMPND 5 SYNONYM: TUMOR SUPPRESSOR PROTEIN DCC, COLORECTAL CANCER
*COMPND 6 SUPPRESSOR;
*COMPND 7 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: HUMAN;
*SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 9606;
*SOURCE 5 GENE: DCC;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: PLASMID;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: P050905-23;
*SOURCE 8 OTHER_DETAILS: CELL-FREE PROTEIN SYNTHESIS
*KEYWDS TUMOR SUPPRESSOR PROTEIN DCC, COLORECTAL CANCER SUPPRESSOR,
*KEYWDS 2 STRUCTURAL GENOMICS, NPPSFA, NATIONAL PROJECT ON PROTEIN
*KEYWDS 3 STRUCTURAL AND FUNCTIONAL ANALYSES, RIKEN STRUCTURAL
*KEYWDS 4 GENOMICS/PROTEOMICS INITIATIVE, RSGI, APOPTOSIS
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 20
*AUTHOR N.TOCHIO, S.KOSHIBA, T.TOMIZAWA, T.KIGAWA, S.YOKOYAMA,
*AUTHOR 2 RIKEN STRUCTURAL GENOMICS/PROTEOMICS INITIATIVE (RSGI)
*REVDAT 1 12-MAY-09 2EDD 0
**************************************************************
During the CYANA calculations automatic implicit swapping of restraints
involving diastereotopic substitutents was applied for prochrial groups
without stereospecific assignment. Diastereotopic substitents were
swapped individually in each conformer to calculate the minimal target
function and restraint violations.
The optimal swapping for a given prochiral group may differ among
the 20 conformers that represent the solution structure. The swapping
is therefore performed implicitly in the program and is not reflected
in the distance restraint file deposited in the PDB.
**************************************************************
;
save_
save_DYANA/DIANA_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2edd
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2edd 1
2 1 . . . parsed_2edd 1
3 1 . . . parsed_2edd 1
4 1 . . . parsed_2edd 1
5 1 . . . parsed_2edd 1
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201 1 2 . . . . . . . . . 35 VAL HN parsed_2edd 1
202 1 1 . . . . . . . . . 34 ALA HA parsed_2edd 1
202 1 2 . . . . . . . . . 35 VAL HN parsed_2edd 1
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209 1 1 . . . . . . . . . 63 SER HN parsed_2edd 1
209 1 2 . . . . . . . . . 63 SER HB3 parsed_2edd 1
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210 1 2 . . . . . . . . . 63 SER HN parsed_2edd 1
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220 1 2 . . . . . . . . . 112 ALA HN parsed_2edd 1
221 1 1 . . . . . . . . . 90 MET HG2 parsed_2edd 1
221 1 2 . . . . . . . . . 112 ALA HN parsed_2edd 1
222 1 1 . . . . . . . . . 106 TRP HN parsed_2edd 1
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224 1 2 . . . . . . . . . 106 TRP HN parsed_2edd 1
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225 1 2 . . . . . . . . . 106 TRP HN parsed_2edd 1
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330 1 2 . . . . . . . . . 104 SER HN parsed_2edd 1
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331 1 2 . . . . . . . . . 104 SER HN parsed_2edd 1
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332 1 2 . . . . . . . . . 104 SER HN parsed_2edd 1
333 1 1 . . . . . . . . . 103 SER HN parsed_2edd 1
333 1 2 . . . . . . . . . 104 SER HN parsed_2edd 1
334 1 1 . . . . . . . . . 19 MET QG parsed_2edd 1
334 1 2 . . . . . . . . . 104 SER HN parsed_2edd 1
335 1 1 . . . . . . . . . 19 MET QE parsed_2edd 1
335 1 2 . . . . . . . . . 104 SER HN parsed_2edd 1
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336 1 2 . . . . . . . . . 104 SER HN parsed_2edd 1
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344 1 1 . . . . . . . . . 94 SER HA parsed_2edd 1
344 1 2 . . . . . . . . . 95 VAL HN parsed_2edd 1
345 1 1 . . . . . . . . . 94 SER HB2 parsed_2edd 1
345 1 2 . . . . . . . . . 95 VAL HN parsed_2edd 1
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346 1 2 . . . . . . . . . 95 VAL HN parsed_2edd 1
347 1 1 . . . . . . . . . 39 TRP HD1 parsed_2edd 1
347 1 2 . . . . . . . . . 41 ASP HN parsed_2edd 1
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348 1 2 . . . . . . . . . 96 MET HN parsed_2edd 1
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350 1 2 . . . . . . . . . 116 GLU HN parsed_2edd 1
351 1 1 . . . . . . . . . 115 TYR HA parsed_2edd 1
351 1 2 . . . . . . . . . 116 GLU HN parsed_2edd 1
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352 1 2 . . . . . . . . . 116 GLU HN parsed_2edd 1
353 1 1 . . . . . . . . . 17 THR HN parsed_2edd 1
353 1 2 . . . . . . . . . 17 THR QG2 parsed_2edd 1
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354 1 2 . . . . . . . . . 17 THR HB parsed_2edd 1
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470 1 2 . . . . . . . . . 65 SER HN parsed_2edd 1
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471 1 2 . . . . . . . . . 65 SER HN parsed_2edd 1
472 1 1 . . . . . . . . . 65 SER HN parsed_2edd 1
472 1 2 . . . . . . . . . 68 ALA QB parsed_2edd 1
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483 1 1 . . . . . . . . . 23 VAL QG1 parsed_2edd 1
483 1 2 . . . . . . . . . 42 ASN HD22 parsed_2edd 1
484 1 1 . . . . . . . . . 23 VAL QG2 parsed_2edd 1
484 1 2 . . . . . . . . . 42 ASN HD22 parsed_2edd 1
485 1 1 . . . . . . . . . 48 GLN QG parsed_2edd 1
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589 1 2 . . . . . . . . . 80 TYR QD parsed_2edd 1
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591 1 2 . . . . . . . . . 64 PHE QE parsed_2edd 1
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594 1 1 . . . . . . . . . 64 PHE HA parsed_2edd 1
594 1 2 . . . . . . . . . 64 PHE QD parsed_2edd 1
595 1 1 . . . . . . . . . 64 PHE QD parsed_2edd 1
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597 1 2 . . . . . . . . . 93 PHE HZ parsed_2edd 1
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598 1 2 . . . . . . . . . 93 PHE HZ parsed_2edd 1
599 1 1 . . . . . . . . . 91 TYR QE parsed_2edd 1
599 1 2 . . . . . . . . . 93 PHE HZ parsed_2edd 1
600 1 1 . . . . . . . . . 91 TYR HB3 parsed_2edd 1
600 1 2 . . . . . . . . . 93 PHE HZ parsed_2edd 1
601 1 1 . . . . . . . . . 87 PRO HA parsed_2edd 1
601 1 2 . . . . . . . . . 114 THR HG1 parsed_2edd 1
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602 1 2 . . . . . . . . . 87 PRO HA parsed_2edd 1
603 1 1 . . . . . . . . . 87 PRO HA parsed_2edd 1
603 1 2 . . . . . . . . . 114 THR HB parsed_2edd 1
604 1 1 . . . . . . . . . 32 HIS HB2 parsed_2edd 1
604 1 2 . . . . . . . . . 87 PRO HA parsed_2edd 1
605 1 1 . . . . . . . . . 87 PRO HA parsed_2edd 1
605 1 2 . . . . . . . . . 114 THR QG2 parsed_2edd 1
606 1 1 . . . . . . . . . 106 TRP HN parsed_2edd 1
606 1 2 . . . . . . . . . 106 TRP HD1 parsed_2edd 1
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607 1 2 . . . . . . . . . 106 TRP HD1 parsed_2edd 1
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608 1 2 . . . . . . . . . 106 TRP HD1 parsed_2edd 1
609 1 1 . . . . . . . . . 105 THR HA parsed_2edd 1
609 1 2 . . . . . . . . . 106 TRP HD1 parsed_2edd 1
610 1 1 . . . . . . . . . 106 TRP HA parsed_2edd 1
610 1 2 . . . . . . . . . 106 TRP HD1 parsed_2edd 1
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613 1 2 . . . . . . . . . 76 THR HA parsed_2edd 1
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614 1 2 . . . . . . . . . 76 THR HA parsed_2edd 1
615 1 1 . . . . . . . . . 57 THR HA parsed_2edd 1
615 1 2 . . . . . . . . . 106 TRP HH2 parsed_2edd 1
616 1 1 . . . . . . . . . 57 THR HA parsed_2edd 1
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859 1 2 . . . . . . . . . 71 LYS QE parsed_2edd 1
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861 1 2 . . . . . . . . . 71 LYS QE parsed_2edd 1
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869 1 2 . . . . . . . . . 99 LYS QE parsed_2edd 1
870 1 1 . . . . . . . . . 99 LYS HG2 parsed_2edd 1
870 1 2 . . . . . . . . . 99 LYS QE parsed_2edd 1
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872 1 1 . . . . . . . . . 20 LEU HB2 parsed_2edd 1
872 1 2 . . . . . . . . . 20 LEU QD2 parsed_2edd 1
873 1 1 . . . . . . . . . 20 LEU HB2 parsed_2edd 1
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875 1 2 . . . . . . . . . 20 LEU QD2 parsed_2edd 1
876 1 1 . . . . . . . . . 20 LEU HB3 parsed_2edd 1
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997 1 2 . . . . . . . . . 111 HIS HB2 parsed_2edd 1
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998 1 2 . . . . . . . . . 111 HIS HB2 parsed_2edd 1
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999 1 2 . . . . . . . . . 111 HIS HB2 parsed_2edd 1
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1001 1 2 . . . . . . . . . 73 GLU HB3 parsed_2edd 1
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1003 1 1 . . . . . . . . . 107 SER HB3 parsed_2edd 1
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1004 1 1 . . . . . . . . . 95 VAL HN parsed_2edd 1
1004 1 2 . . . . . . . . . 107 SER HB2 parsed_2edd 1
1005 1 1 . . . . . . . . . 107 SER HB2 parsed_2edd 1
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1132 1 2 . . . . . . . . . 108 MET HG3 parsed_2edd 1
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1135 1 1 . . . . . . . . . 19 MET QG parsed_2edd 1
1135 1 2 . . . . . . . . . 97 VAL QG2 parsed_2edd 1
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1242 1 2 . . . . . . . . . 78 LEU HG parsed_2edd 1
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1255 1 2 . . . . . . . . . 102 ARG HG2 parsed_2edd 1
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1256 1 2 . . . . . . . . . 102 ARG HG2 parsed_2edd 1
1257 1 1 . . . . . . . . . 102 ARG HA parsed_2edd 1
1257 1 2 . . . . . . . . . 102 ARG HG3 parsed_2edd 1
1258 1 1 . . . . . . . . . 19 MET QG parsed_2edd 1
1258 1 2 . . . . . . . . . 102 ARG HG3 parsed_2edd 1
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1363 1 2 . . . . . . . . . 86 LYS HG2 parsed_2edd 1
1364 1 1 . . . . . . . . . 86 LYS HG2 parsed_2edd 1
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1365 1 1 . . . . . . . . . 86 LYS HG2 parsed_2edd 1
1365 1 2 . . . . . . . . . 89 THR HB parsed_2edd 1
1366 1 1 . . . . . . . . . 86 LYS HG2 parsed_2edd 1
1366 1 2 . . . . . . . . . 87 PRO HD2 parsed_2edd 1
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1367 1 2 . . . . . . . . . 86 LYS QE parsed_2edd 1
1368 1 1 . . . . . . . . . 86 LYS HG2 parsed_2edd 1
1368 1 2 . . . . . . . . . 89 THR QG2 parsed_2edd 1
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1371 1 2 . . . . . . . . . 114 THR QG2 parsed_2edd 1
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1378 1 2 . . . . . . . . . 114 THR QG2 parsed_2edd 1
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1752 1 1 . . . . . . . . . 29 ALA QB parsed_2edd 1
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1761 1 2 . . . . . . . . . 67 SER HA parsed_2edd 1
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1765 1 2 . . . . . . . . . 48 GLN QG parsed_2edd 1
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1866 1 2 . . . . . . . . . 104 SER HG parsed_2edd 1
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1867 1 2 . . . . . . . . . 103 SER HA parsed_2edd 1
1868 1 1 . . . . . . . . . 96 MET QE parsed_2edd 1
1868 1 2 . . . . . . . . . 97 VAL HA parsed_2edd 1
1869 1 1 . . . . . . . . . 96 MET QE parsed_2edd 1
1869 1 2 . . . . . . . . . 98 THR HA parsed_2edd 1
1870 1 1 . . . . . . . . . 96 MET HA parsed_2edd 1
1870 1 2 . . . . . . . . . 96 MET QE parsed_2edd 1
1871 1 1 . . . . . . . . . 96 MET QE parsed_2edd 1
1871 1 2 . . . . . . . . . 105 THR HA parsed_2edd 1
1872 1 1 . . . . . . . . . 96 MET QE parsed_2edd 1
1872 1 2 . . . . . . . . . 106 TRP HA parsed_2edd 1
1873 1 1 . . . . . . . . . 96 MET QE parsed_2edd 1
1873 1 2 . . . . . . . . . 103 SER HB2 parsed_2edd 1
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1877 1 2 . . . . . . . . . 15 LEU QB parsed_2edd 1
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1882 1 1 . . . . . . . . . 19 MET QE parsed_2edd 1
1882 1 2 . . . . . . . . . 99 LYS HB3 parsed_2edd 1
1883 1 1 . . . . . . . . . 19 MET HB2 parsed_2edd 1
1883 1 2 . . . . . . . . . 19 MET QE parsed_2edd 1
1884 1 1 . . . . . . . . . 19 MET QE parsed_2edd 1
1884 1 2 . . . . . . . . . 99 LYS HB2 parsed_2edd 1
1885 1 1 . . . . . . . . . 19 MET QE parsed_2edd 1
1885 1 2 . . . . . . . . . 97 VAL QG2 parsed_2edd 1
1886 1 1 . . . . . . . . . 90 MET HG2 parsed_2edd 1
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1889 1 2 . . . . . . . . . 109 THR HB parsed_2edd 1
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1985 1 1 . . . . . . . . . 19 MET QE parsed_2edd 1
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1987 1 2 . . . . . . . . . 99 LYS QD parsed_2edd 1
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1999 1 2 . . . . . . . . . 25 VAL QQG parsed_2edd 1
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2002 1 2 . . . . . . . . . 39 TRP HB3 parsed_2edd 1
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2012 1 2 . . . . . . . . . 97 VAL QQG parsed_2edd 1
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2013 1 2 . . . . . . . . . 23 VAL QQG parsed_2edd 1
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2016 1 1 . . . . . . . . . 23 VAL QQG parsed_2edd 1
2016 1 2 . . . . . . . . . 24 GLY QA parsed_2edd 1
2017 1 1 . . . . . . . . . 23 VAL QQG parsed_2edd 1
2017 1 2 . . . . . . . . . 25 VAL HN parsed_2edd 1
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2270 1 2 . . . . . . . . . 74 ASP HA parsed_2edd 1
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36 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 119.0 179.0 . . 73 GLU . . . . . . . . . . . . . parsed_2edd 1
37 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -148.0 -88.0 . . 74 ASP . . . . . . . . . . . . . parsed_2edd 1
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save_
save_DYANA/DIANA_distance_constraints_4
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2edd
_Distance_constraint_list.ID 2
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
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_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
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_Dist_constraint_tree.Logic_operation
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_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2edd 2
2 1 . . . parsed_2edd 2
stop_
loop_
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_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
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stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
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_Dist_constraint_value.Entry_ID
_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
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save_
Contact the webmaster for help, if required. Thursday, May 16, 2024 1:56:17 AM GMT (wattos1)