NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
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39738 |
1tr4   |
5898 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 3185 |
data_1tr4_MR_file_constraints
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_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_1tr4
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
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_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1tr4 1
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save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1tr4
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1tr4 "Master copy" parsed_1tr4
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save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1tr4
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1tr4.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1tr4 1
1 1tr4.mr . . XPLOR/CNS 2 distance "general distance" simple 703 parsed_1tr4 1
1 1tr4.mr . . XPLOR/CNS 3 distance NOE simple 413 parsed_1tr4 1
1 1tr4.mr . . XPLOR/CNS 4 distance "general distance" simple 343 parsed_1tr4 1
1 1tr4.mr . . XPLOR/CNS 5 distance NOE simple 300 parsed_1tr4 1
1 1tr4.mr . . XPLOR/CNS 6 distance "general distance" simple 905 parsed_1tr4 1
1 1tr4.mr . . n/a 7 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1tr4 1
1 1tr4.mr . . XPLOR/CNS 8 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 140 parsed_1tr4 1
1 1tr4.mr . . XPLOR/CNS 9 distance "hydrogen bond" simple 154 parsed_1tr4 1
1 1tr4.mr . . XPLOR/CNS 10 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 227 parsed_1tr4 1
1 1tr4.mr . . "MR format" 11 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1tr4 1
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_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1tr4
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER UNKNOWN FUNCTION 19-JUN-04 1TR4
*TITLE SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN ONCOGENIC PROTEIN GANKYRIN
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: 26S PROTEASOME NON-ATPASE REGULATORY SUBUNIT 10;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 SYNONYM: 26S PROTEASOME REGULATORY SUBUNIT P28, GANKYRIN;
*COMPND 5 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: HUMAN;
*SOURCE 4 GENE: PSMD10;
*SOURCE 5 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM_COMMON: BACTERIA
*KEYWDS GANKYRIN, ONCOPROTEIN, ANKYRIN REPEATS, NMR, PROTEIN
*KEYWDS 2 STRUCTURE
*EXPDTA NMR, 20 STRUCTURES
*AUTHOR C.YUAN, J.LI, A.MAHAJAN, M.J.POI, I.J.BYEON, M.D.TSAI
*REVDAT 1 16-NOV-04 1TR4 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1tr4
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type "general distance"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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stop_
loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
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_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
1
;
Gankyrin NOE assignment
--------------------------------------------------------------------------
Long range NOEs (i-j>=5)
--------------------------------------------------------------------------
;
2 1 5 76 parsed_1tr4 1
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save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_3
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_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
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loop_
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stop_
loop_
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H-bonds constraints for helix region
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111
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helix 14
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H-bond constraints for betasheet in the loop
------------------------------------------------------------------------------------
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112
;
------------------------------------------------------------------------------------
H-bond constrainst for the side chain Histidine and Threonine
------------------------------------------------------------------------------------
;
124 77 127 86 parsed_1tr4 6
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stop_
loop_
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1
;
------------------------------------------------------------------------------
The following are extracted from experimental data (NOE intensities)
------------------------------------------------------------------------------
! V5
;
3 1 7 12 parsed_1tr4 1
2 "! N67" 11 4 11 12 parsed_1tr4 1
3 "! V123" 16 4 16 14 parsed_1tr4 1
4 "! V185" 21 4 21 14 parsed_1tr4 1
5 "! V211" 26 4 26 14 parsed_1tr4 1
6
;
-------------------------------------------------------------------------------
The following are from the prediction using TALOS
-------------------------------------------------------------------------------
;
30 1 32 81 parsed_1tr4 1
stop_
save_
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