NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
384180 | 1ka6 | 5212 | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1ka6 save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 1860 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 85 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 1.796 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.187 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0082 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0010 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0211 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 2 ASP 0.019 0.013 1 0 "[ ]" 1 3 ALA 0.019 0.013 1 0 "[ ]" 1 4 VAL 0.009 0.009 1 0 "[ ]" 1 5 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 6 VAL 0.030 0.018 1 0 "[ ]" 1 7 TYR 0.009 0.009 1 0 "[ ]" 1 8 HIS 0.009 0.009 1 0 "[ ]" 1 9 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 10 LYS 0.001 0.001 1 0 "[ ]" 1 11 ILE 0.022 0.014 1 0 "[ ]" 1 12 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 13 ARG 0.019 0.019 1 0 "[ ]" 1 14 GLU 0.027 0.021 1 0 "[ ]" 1 15 THR 0.042 0.021 1 0 "[ ]" 1 16 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 17 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 18 LYS 0.019 0.019 1 0 "[ ]" 1 19 LEU 0.022 0.022 1 0 "[ ]" 1 20 LEU 0.054 0.040 1 0 "[ ]" 1 21 LEU 0.020 0.020 1 0 "[ ]" 1 22 ALA 0.009 0.009 1 0 "[ ]" 1 23 THR 0.012 0.009 1 0 "[ ]" 1 24 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 25 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 26 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 27 GLY 0.029 0.029 1 0 "[ ]" 1 28 SER 0.196 0.187 1 0 "[ ]" 1 29 TYR 0.280 0.149 1 0 "[ ]" 1 30 LEU 0.230 0.116 1 0 "[ ]" 1 31 LEU 0.125 0.116 1 0 "[ ]" 1 32 ARG 0.089 0.033 1 0 "[ ]" 1 33 ASP 0.001 0.001 1 0 "[ ]" 1 34 SER 0.004 0.004 1 0 "[ ]" 1 35 GLU 0.012 0.012 1 0 "[ ]" 1 36 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 37 VAL 0.012 0.012 1 0 "[ ]" 1 38 PRO 0.024 0.012 1 0 "[ ]" 1 39 GLY 0.012 0.012 1 0 "[ ]" 1 40 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 41 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 42 CYS 0.075 0.041 1 0 "[ ]" 1 43 LEU 0.026 0.017 1 0 "[ ]" 1 44 CYS 0.050 0.050 1 0 "[ ]" 1 45 VAL 0.046 0.033 1 0 "[ ]" 1 46 LEU 0.079 0.040 1 0 "[ ]" 1 47 TYR 0.062 0.020 1 0 "[ ]" 1 48 HIS 0.009 0.009 1 0 "[ ]" 1 49 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 50 TYR 0.005 0.005 1 0 "[ ]" 1 51 ILE 0.117 0.050 1 0 "[ ]" 1 52 TYR 0.035 0.024 1 0 "[ ]" 1 53 THR 0.044 0.024 1 0 "[ ]" 1 54 TYR 0.013 0.013 1 0 "[ ]" 1 55 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 56 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 57 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 58 GLN 0.009 0.009 1 0 "[ ]" 1 59 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 60 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 61 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 62 GLY 0.009 0.009 1 0 "[ ]" 1 63 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 64 TRP 0.045 0.045 1 0 "[ ]" 1 65 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 66 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 67 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 68 THR 0.013 0.013 1 0 "[ ]" 1 69 ALA 0.009 0.009 1 0 "[ ]" 1 70 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 71 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 72 VAL 0.013 0.013 1 0 "[ ]" 1 73 HIS 0.005 0.005 1 0 "[ ]" 1 74 LYS 0.023 0.018 1 0 "[ ]" 1 75 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 76 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 77 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 78 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 79 LYS 0.036 0.029 1 0 "[ ]" 1 80 ILE 0.030 0.012 1 0 "[ ]" 1 81 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 82 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 83 LEU 0.040 0.021 1 0 "[ ]" 1 84 ILE 0.019 0.019 1 0 "[ ]" 1 85 SER 0.008 0.008 1 0 "[ ]" 1 86 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 87 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 88 GLN 0.078 0.037 1 0 "[ ]" 1 89 LYS 0.019 0.010 1 0 "[ ]" 1 90 PRO 0.009 0.009 1 0 "[ ]" 1 91 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 92 GLN 0.000 0.000 1 0 "[ ]" 1 93 GLY 0.022 0.013 1 0 "[ ]" 1 94 ILE 0.010 0.009 1 0 "[ ]" 1 95 VAL 0.023 0.020 1 0 "[ ]" 1 96 ILE 0.048 0.018 1 0 "[ ]" 1 97 PRO 0.028 0.018 1 0 "[ ]" 1 98 LEU 0.096 0.037 1 0 "[ ]" 1 99 GLN 0.020 0.014 1 0 "[ ]" 1 100 TYR 0.006 0.006 1 0 "[ ]" 1 101 PRO 0.435 0.187 1 0 "[ ]" 1 102 VAL 0.116 0.116 1 0 "[ ]" 1 103 GLU 0.012 0.012 1 0 "[ ]" 1 104 LYS 0.018 0.018 1 0 "[ ]" 1 105 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 4 LEU 0.075 0.035 1 0 "[ ]" 2 5 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 6 ILE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 7 PTR 0.061 0.041 1 0 "[ ]" 2 8 ALA 0.002 0.001 1 0 "[ ]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 2 ASP HA 1 3 ALA H 2.800 2.400 3.200 2.393 2.393 2.393 0.007 1 0 "[ ]" 1 2 1 2 ASP HA 1 3 ALA MB 4.800 4.300 5.300 4.287 4.287 4.287 0.013 1 0 "[ ]" 1 3 1 2 ASP HA 1 4 VAL H 4.800 4.200 5.400 4.316 4.316 4.316 . 0 0 "[ ]" 1 4 1 2 ASP HB2 1 3 ALA H 4.600 4.000 5.200 4.661 4.661 4.661 . 0 0 "[ ]" 1 5 1 2 ASP HB2 1 3 ALA MB 6.000 5.100 6.000 5.926 5.926 5.926 . 0 0 "[ ]" 1 6 1 2 ASP HB2 1 4 VAL MG2 4.900 4.300 5.500 5.027 5.027 5.027 . 0 0 "[ ]" 1 7 1 2 ASP HB3 1 3 ALA H 4.200 3.700 4.700 4.411 4.411 4.411 . 0 0 "[ ]" 1 8 1 3 ALA H 1 3 ALA HA 3.200 2.700 3.700 2.921 2.921 2.921 . 0 0 "[ ]" 1 9 1 3 ALA H 1 3 ALA MB 2.700 . 3.500 2.331 2.331 2.331 . 0 0 "[ ]" 1 10 1 3 ALA HA 1 3 ALA MB 2.400 . 2.800 2.116 2.116 2.116 . 0 0 "[ ]" 1 11 1 3 ALA HA 1 4 VAL H 2.400 . 2.800 2.438 2.438 2.438 . 0 0 "[ ]" 1 12 1 3 ALA HA 1 4 VAL MG2 3.900 3.400 4.400 4.043 4.043 4.043 . 0 0 "[ ]" 1 13 1 3 ALA MB 1 4 VAL H 4.100 3.100 5.100 3.701 3.701 3.701 . 0 0 "[ ]" 1 14 1 3 ALA MB 1 4 VAL MG1 5.600 4.900 6.000 5.376 5.376 5.376 . 0 0 "[ ]" 1 15 1 3 ALA MB 1 4 VAL MG2 4.800 3.500 6.000 3.834 3.834 3.834 . 0 0 "[ ]" 1 16 1 4 VAL H 1 4 VAL HB 2.700 2.300 3.100 2.714 2.714 2.714 . 0 0 "[ ]" 1 17 1 4 VAL H 1 4 VAL MG2 2.700 2.300 3.100 2.666 2.666 2.666 . 0 0 "[ ]" 1 18 1 4 VAL H 1 6 VAL MG2 6.000 5.300 6.000 5.969 5.969 5.969 . 0 0 "[ ]" 1 19 1 4 VAL HA 1 4 VAL HB 2.900 2.500 3.300 3.023 3.023 3.023 . 0 0 "[ ]" 1 20 1 4 VAL HA 1 4 VAL MG1 2.700 . 3.500 2.281 2.281 2.281 . 0 0 "[ ]" 1 21 1 4 VAL HA 1 4 VAL MG2 3.100 2.200 4.000 2.476 2.476 2.476 . 0 0 "[ ]" 1 22 1 4 VAL HA 1 7 TYR HB3 6.000 5.200 6.000 5.913 5.913 5.913 . 0 0 "[ ]" 1 23 1 4 VAL HB 1 4 VAL MG1 2.300 . 3.000 2.114 2.114 2.114 . 0 0 "[ ]" 1 24 1 4 VAL HB 1 4 VAL QG 2.000 . 2.300 1.886 1.886 1.886 . 0 0 "[ ]" 1 25 1 4 VAL HB 1 4 VAL MG2 2.300 . 2.700 2.121 2.121 2.121 . 0 0 "[ ]" 1 26 1 4 VAL HB 1 7 TYR QE 5.400 4.800 6.000 5.729 5.729 5.729 . 0 0 "[ ]" 1 27 1 4 VAL MG1 1 7 TYR HA 4.300 3.700 4.900 3.691 3.691 3.691 0.009 1 0 "[ ]" 1 28 1 4 VAL MG1 1 7 TYR HB2 3.200 2.800 3.600 2.925 2.925 2.925 . 0 0 "[ ]" 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