NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
569673 |
2ltr   |
17703 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 779 |
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_Study_list.ID 1
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1 "Conversion project" NMR . parsed_2ltr 1
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_Entry.Sf_category entry_information
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_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2ltr "Master copy" parsed_2ltr
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
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_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2ltr.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ltr 1
1 2ltr.mr . . XPLOR/CNS 2 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 182 parsed_2ltr 1
1 2ltr.mr . . XPLOR/CNS 3 distance NOE simple 416 parsed_2ltr 1
1 2ltr.mr . . XPLOR/CNS 4 distance PRE "Not applicable" 33 parsed_2ltr 1
1 2ltr.mr . . XPLOR/CNS 5 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 46 parsed_2ltr 1
1 2ltr.mr . . XPLOR/CNS 6 distance "hydrogen bond" simple 102 parsed_2ltr 1
1 2ltr.mr . . "MR format" 7 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ltr 1
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_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER RNA BINDING PROTEIN 31-MAY-12 2LTR
*TITLE SOLUTION STRUCTURE OF RDE-4(32-136)
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: PROTEIN RDE-4;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 FRAGMENT: DSRBD1 (UNIPROT RESIDUES 32-136);
*COMPND 5 SYNONYM: RNA INTERFERENCE PROMOTING FACTOR;
*COMPND 6 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: CAENORHABDITIS ELEGANS;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: NEMATODE;
*SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 6239;
*SOURCE 5 GENE: RDE-4, T20G5.11;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562;
*SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: PLASMID;
*SOURCE 9 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: PET28A
*KEYWDS RDE-4, DSRBD1, RNAI, RDE-4DC, RNA BINDING PROTEIN
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 10
*AUTHOR M.DESHMUKH, S.CHILIVERI
*REVDAT 1 04-DEC-13 2LTR 0
;
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save_CNS/XPLOR_dihedral_2
_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_2ltr
_Torsion_angle_constraint_list.ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 2
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Torsion_angle_constraint.ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_name
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_Torsion_angle_constraint.Angle_lower_bound_val
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_Torsion_angle_constraint.Source_experiment_ID
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_Torsion_angle_constraint.Entry_ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_constraint_list_ID
1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -111.72 -39.34 . . 34 . C . 35 . N . 35 . CA . 35 . C parsed_2ltr 1
2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -78.76 -55.50 . . 35 . C . 36 . N . 36 . CA . 36 . C parsed_2ltr 1
3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -75.86 -49.12 . . 36 . C . 37 . N . 37 . CA . 37 . C parsed_2ltr 1
4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -73.31 -58.15 . . 37 . C . 38 . N . 38 . CA . 38 . C parsed_2ltr 1
5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -77.57 -48.71 . . 38 . C . 39 . N . 39 . CA . 39 . C parsed_2ltr 1
6 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -81.31 -54.15 . . 39 . C . 40 . N . 40 . CA . 40 . C parsed_2ltr 1
7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -117.52 -68.22 . . 40 . C . 41 . N . 41 . CA . 41 . C parsed_2ltr 1
8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -167.14 -49.40 . . 42 . C . 43 . N . 43 . CA . 43 . C parsed_2ltr 1
9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -81.19 -51.55 . . 44 . C . 45 . N . 45 . CA . 45 . C parsed_2ltr 1
10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -73.09 -59.75 . . 45 . C . 46 . N . 46 . CA . 46 . C parsed_2ltr 1
11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -77.53 -51.89 . . 46 . C . 47 . N . 47 . CA . 47 . C parsed_2ltr 1
12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -77.97 -52.87 . . 47 . C . 48 . N . 48 . CA . 48 . C parsed_2ltr 1
13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -75.84 -49.62 . . 48 . C . 49 . N . 49 . CA . 49 . C parsed_2ltr 1
14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -76.57 -55.11 . . 49 . C . 50 . N . 50 . CA . 50 . C parsed_2ltr 1
15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -75.01 -57.31 . . 50 . C . 51 . N . 51 . CA . 51 . C parsed_2ltr 1
16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -77.45 -48.43 . . 51 . C . 52 . N . 52 . CA . 52 . C parsed_2ltr 1
17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -77.17 -48.07 . . 52 . C . 53 . N . 53 . CA . 53 . C parsed_2ltr 1
18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -73.95 -49.71 . . 53 . C . 54 . N . 54 . CA . 54 . C parsed_2ltr 1
19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -84.83 -46.77 . . 54 . C . 55 . N . 55 . CA . 55 . C parsed_2ltr 1
20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -124.55 -78.29 . . 55 . C . 56 . N . 56 . CA . 56 . C parsed_2ltr 1
21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40.38 82.24 . . 56 . C . 57 . N . 57 . CA . 57 . C parsed_2ltr 1
22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -164.23 -96.57 . . 57 . C . 58 . N . 58 . CA . 58 . C parsed_2ltr 1
23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -144.28 -78.72 . . 58 . C . 59 . N . 59 . CA . 59 . C parsed_2ltr 1
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33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -112.25 -68.59 . . 68 . C . 69 . N . 69 . CA . 69 . C parsed_2ltr 1
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stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_4
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_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2ltr
_Distance_constraint_list.ID 2
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_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
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_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
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_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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2 1 . . . parsed_2ltr 2
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5 1 . . . parsed_2ltr 2
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stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
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_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
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_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
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33 1 2 . . . . . . . . . 45 . HN parsed_2ltr 2
stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
_Dist_constraint_value.Tree_node_ID
_Dist_constraint_value.Source_experiment_ID
_Dist_constraint_value.Spectral_peak_ID
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_Dist_constraint_value.Entry_ID
_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
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2 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
3 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
4 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
5 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
6 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
7 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
8 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
9 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
10 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
11 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
12 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
13 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
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15 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
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17 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
18 1 . . . . . 10.0 5.0 15.0 parsed_2ltr 2
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33 1 . . . . . 20.0 15.0 25.0 parsed_2ltr 2
stop_
loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
_Dist_constraint_comment_org.Comment_text
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
1 !N32C-PRE 1 1 1 11 parsed_2ltr 2
stop_
loop_
_Dist_constraint_parse_err.ID
_Dist_constraint_parse_err.Content
_Dist_constraint_parse_err.Begin_line
_Dist_constraint_parse_err.Begin_column
_Dist_constraint_parse_err.End_line
_Dist_constraint_parse_err.End_column
_Dist_constraint_parse_err.Entry_ID
_Dist_constraint_parse_err.Distance_constraint_list_ID
1
;
assign ( resid 600 and name OO )
( resid 600 and name Z )
( resid 600 and name X )
( resid 600 and name Y )
( resid 36 and name N )
( resid 36 and name HN ) -2.4541 2.0000
;
35 73 40 52 parsed_2ltr 2
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_dipolar_coupling_5
_RDC_constraint_list.Sf_category RDC_constraints
_RDC_constraint_list.Entry_ID parsed_2ltr
_RDC_constraint_list.ID 1
_RDC_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_RDC_constraint_list.Block_ID 5
_RDC_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
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_RDC_constraint.Atom_ID_2
_RDC_constraint.Resonance_ID_2
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_RDC_constraint.Auth_comp_ID_2
_RDC_constraint.Auth_atom_ID_2
_RDC_constraint.Entry_ID
_RDC_constraint.RDC_constraint_list_ID
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4 . . . . . . . . . . . . . . . . -1.9326 . . . . . 47 . N . 47 . HN parsed_2ltr 1
5 . . . . . . . . . . . . . . . . -1.1391 . . . . . 48 . N . 48 . HN parsed_2ltr 1
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15 . . . . . . . . . . . . . . . . 4.4390 . . . . . 66 . N . 66 . HN parsed_2ltr 1
16 . . . . . . . . . . . . . . . . 1.0595 . . . . . 67 . N . 67 . HN parsed_2ltr 1
17 . . . . . . . . . . . . . . . . -1.0899 . . . . . 70 . N . 70 . HN parsed_2ltr 1
18 . . . . . . . . . . . . . . . . -1.1763 . . . . . 71 . N . 71 . HN parsed_2ltr 1
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20 . . . . . . . . . . . . . . . . 4.6408 . . . . . 73 . N . 73 . HN parsed_2ltr 1
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45 . . . . . . . . . . . . . . . . -7.9060 . . . . . 129 . N . 129 . HN parsed_2ltr 1
46 . . . . . . . . . . . . . . . . 2.8186 . . . . . 130 . N . 130 . HN parsed_2ltr 1
stop_
loop_
_RDC_constraint_comment_org.ID
_RDC_constraint_comment_org.Comment_text
_RDC_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_RDC_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_RDC_constraint_comment_org.Comment_end_line
_RDC_constraint_comment_org.Comment_end_column
_RDC_constraint_comment_org.Entry_ID
_RDC_constraint_comment_org.RDC_constraint_list_ID
1 "! H-bond restraints" 276 53 276 73 parsed_2ltr 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_6
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2ltr
_Distance_constraint_list.ID 3
_Distance_constraint_list.Constraint_type "hydrogen bond"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 6
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2ltr 3
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101 1 . . . parsed_2ltr 3
102 1 . . . parsed_2ltr 3
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
_Dist_constraint.Auth_seq_ID
_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
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4 1 2 . . . . . . . . . 40 . N parsed_2ltr 3
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5 1 2 . . . . . . . . . 41 . HN parsed_2ltr 3
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19 1 2 . . . . . . . . . 55 . HN parsed_2ltr 3
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20 1 2 . . . . . . . . . 55 . N parsed_2ltr 3
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23 1 2 . . . . . . . . . 61 . HN parsed_2ltr 3
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loop_
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~~~~~~~~~~~~~~~~~ end of helix ~~~~~~~~~~~~~~~~
############ Linker region ####################
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6 "~~~~~~~~~~~~~ end of helix ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~" 223 1 223 50 parsed_2ltr 3
stop_
save_
Contact the webmaster for help, if required. Thursday, May 23, 2024 11:01:24 PM GMT (wattos1)