NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
45655 |
2edb   |
11099 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 3250 |
data_2edb_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2edb
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2edb 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2edb
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2edb "Master copy" parsed_2edb
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2edb
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2edb.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2edb 1
1 2edb.mr . . DYANA/DIANA 2 distance NOE simple 3177 parsed_2edb 1
1 2edb.mr . . DYANA/DIANA 3 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 72 parsed_2edb 1
1 2edb.mr . . DYANA/DIANA 4 distance NOE simple 1 parsed_2edb 1
1 2edb.mr . . "MR format" 5 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2edb 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_2edb
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER APOPTOSIS 14-FEB-07 2EDB
*TITLE SOLUTION STRUCTURE OF THE FOURTH FIBRONECTIN TYPE III
*TITLE 2 DOMAIN OF HUMAN NETRIN RECEPTOR DCC
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: NETRIN RECEPTOR DCC;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 FRAGMENT: FOURTH FN3 DOMAIN;
*COMPND 5 SYNONYM: TUMOR SUPPRESSOR PROTEIN DCC, COLORECTAL CANCER
*COMPND 6 SUPPRESSOR;
*COMPND 7 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: HUMAN;
*SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 9606;
*SOURCE 5 GENE: DCC;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: PLASMID;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: P050905-22;
*SOURCE 8 OTHER_DETAILS: CELL-FREE PROTEIN SYNTHESIS
*KEYWDS TUMOR SUPPRESSOR PROTEIN DCC, COLORECTAL CANCER SUPPRESSOR,
*KEYWDS 2 STRUCTURAL GENOMICS, NPPSFA, NATIONAL PROJECT ON PROTEIN
*KEYWDS 3 STRUCTURAL AND FUNCTIONAL ANALYSES, RIKEN STRUCTURAL
*KEYWDS 4 GENOMICS/PROTEOMICS INITIATIVE, RSGI, APOPTOSIS
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 20
*AUTHOR N.TOCHIO, S.KOSHIBA, T.KIGAWA, S.YOKOYAMA, RIKEN STRUCTURAL
*AUTHOR 2 GENOMICS/PROTEOMICS INITIATIVE (RSGI)
*REVDAT 1 12-MAY-09 2EDB 0
**************************************************************
During the CYANA calculations automatic implicit swapping of restraints
involving diastereotopic substitutents was applied for prochrial groups
without stereospecific assignment. Diastereotopic substitents were
swapped individually in each conformer to calculate the minimal target
function and restraint violations.
The optimal swapping for a given prochiral group may differ among
the 20 conformers that represent the solution structure. The swapping
is therefore performed implicitly in the program and is not reflected
in the distance restraint file deposited in the PDB.
**************************************************************
;
save_
save_DYANA/DIANA_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2edb
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2edb 1
2 1 . . . parsed_2edb 1
3 1 . . . parsed_2edb 1
4 1 . . . parsed_2edb 1
5 1 . . . parsed_2edb 1
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11 1 . . . parsed_2edb 1
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13 1 . . . parsed_2edb 1
14 1 . . . parsed_2edb 1
15 1 . . . parsed_2edb 1
16 1 . . . parsed_2edb 1
17 1 . . . parsed_2edb 1
18 1 . . . parsed_2edb 1
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22 1 . . . parsed_2edb 1
23 1 . . . parsed_2edb 1
24 1 . . . parsed_2edb 1
25 1 . . . parsed_2edb 1
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27 1 . . . parsed_2edb 1
28 1 . . . parsed_2edb 1
29 1 . . . parsed_2edb 1
30 1 . . . parsed_2edb 1
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107 1 . . . parsed_2edb 1
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111 1 . . . parsed_2edb 1
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119 1 . . . parsed_2edb 1
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121 1 . . . parsed_2edb 1
122 1 . . . parsed_2edb 1
123 1 . . . parsed_2edb 1
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126 1 . . . parsed_2edb 1
127 1 . . . parsed_2edb 1
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Contact the webmaster for help, if required. Tuesday, May 14, 2024 1:17:53 PM GMT (wattos1)