NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
484128 | 2g1d | 6989 | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_2g1d save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 924 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 1319 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 24354.717 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 16.580 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 1.1226 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.2636 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 1.8465 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 1 MET 1.822 0.213 9 0 "[ . 1]" 1 2 ASP 4.531 0.435 2 0 "[ . 1]" 1 3 LEU 2.171 0.207 2 0 "[ . 1]" 1 4 ILE 128.435 6.147 8 10 [*******+*-] 1 5 ILE 265.182 7.054 4 10 [***+******] 1 6 LYS 299.782 6.381 8 10 [***-***+**] 1 7 GLU 207.903 5.906 7 10 [*****-+***] 1 8 LYS 490.088 7.347 10 10 [****-****+] 1 9 ARG 183.709 4.143 10 10 [*****-***+] 1 10 ASP 197.890 5.906 7 10 [******+***] 1 11 ASN 252.523 7.347 10 10 [*********+] 1 13 ILE 0.126 0.064 10 0 "[ . 1]" 1 14 LEU 2.738 0.464 7 0 "[ . 1]" 1 15 LYS 43.465 5.221 10 10 [**-******+] 1 16 ARG 10.645 0.950 5 9 [-***+****1] 1 17 LYS 14.351 1.603 10 10 [******-**+] 1 18 GLU 10.867 0.807 1 8 [+***.*-**1] 1 19 ILE 251.578 4.132 1 10 [+*******-*] 1 20 LYS 538.175 7.178 1 10 [+***-*****] 1 21 TYR 69.467 3.715 1 10 [+*******-*] 1 22 VAL 181.660 5.679 5 10 [-***+*****] 1 23 LEU 422.066 6.520 3 10 [*-+*******] 1 24 LYS 136.050 6.381 8 10 [*******+*-] 1 25 PHE 128.269 7.054 4 10 [***+-*****] 1 26 ASP 57.206 5.483 8 10 [****-**+**] 1 27 SER 0.131 0.099 5 0 "[ . 1]" 1 28 SER 0.066 0.066 1 0 "[ . 1]" 1 29 ARG 0.197 0.099 5 0 "[ . 1]" 1 30 THR 149.393 16.580 8 10 [******-+**] 1 32 SER 1.268 0.156 6 0 "[ . 1]" 1 33 ARG 0.998 0.067 6 0 "[ . 1]" 1 34 GLU 1.057 0.201 5 0 "[ . 1]" 1 35 GLU 0.682 0.201 5 0 "[ . 1]" 1 36 ILE 7.826 0.980 2 7 "[*+*** -*]" 1 37 LYS 7.319 0.815 1 2 "[+ -. 1]" 1 38 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 39 LEU 6.226 0.980 2 7 "[*+*** -*]" 1 40 ILE 1.642 0.143 1 0 "[ . 1]" 1 41 ALA 8.623 0.815 1 2 "[+ -. 1]" 1 42 LYS 4.952 0.381 2 0 "[ . 1]" 1 43 HIS 52.739 5.256 10 10 [***-*****+] 1 44 GLU 6.576 0.584 2 8 "[*+* * **-*]" 1 45 GLY 5.252 0.584 2 8 "[*+* * **-*]" 1 46 VAL 0.014 0.014 1 0 "[ . 1]" 1 47 ASP 24.199 1.723 1 10 [+*********] 1 48 LYS 74.908 5.256 10 10 [-********+] 1 49 GLU 0.591 0.076 7 0 "[ . 1]" 1 50 LEU 1.809 0.173 6 0 "[ . 1]" 1 51 VAL 3.534 0.371 5 0 "[ . 1]" 1 52 ILE 5.758 0.701 6 7 "[**-*.+* *]" 1 53 VAL 0.431 0.143 1 0 "[ . 1]" 1 54 ASP 1.605 0.233 6 0 "[ . 1]" 1 55 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 56 ASN 0.607 0.116 4 0 "[ . 1]" 1 57 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 58 GLN 1.392 0.149 7 0 "[ . 1]" 1 59 LEU 1.158 0.236 1 0 "[ . 1]" 1 60 THR 149.597 16.580 8 10 [******-+**] 1 61 GLY 0.272 0.071 1 0 "[ . 1]" 1 62 LYS 6.316 0.748 4 7 "[* *+* **-1]" 1 63 HIS 6.018 0.748 4 7 "[* *+* **-1]" 1 64 GLU 10.885 1.154 5 10 [****+****-] 1 65 ILE 2.024 0.973 10 1 "[ . +]" 1 66 GLU 1.034 0.180 10 0 "[ . 1]" 1 67 GLY 8.468 1.056 10 9 "[*-**** **+]" 1 68 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 69 THR 0.206 0.108 1 0 "[ . 1]" 1 70 LYS 47.433 5.008 1 10 [+*-*******] 1 71 ILE 180.902 7.178 1 10 [+*****-***] 1 72 TYR 49.802 4.132 1 10 [+*****-***] 1 73 ALA 3.011 0.658 1 1 "[+ . 1]" 1 74 ASP 0.219 0.163 10 0 "[ . 1]" 1 75 LYS 41.505 5.221 10 10 [**-******+] 1 77 SER 0.216 0.042 5 0 "[ . 1]" 1 78 ALA 0.163 0.042 5 0 "[ . 1]" 1 79 MET 0.709 0.190 8 0 "[ . 1]" 1 80 LEU 0.976 0.072 5 0 "[ . 1]" 1 81 TYR 7.774 0.733 4 6 "[-* +.* **1]" 1 82 GLU 5.851 0.733 4 6 "[-* +.* **1]" 1 87 LEU 0.794 0.094 5 0 "[ . 1]" 1 88 ILE 0.257 0.137 9 0 "[ . 1]" 1 89 ARG 11.496 1.786 9 7 "[ ***. *-+*]" 1 90 ASN 12.032 1.786 9 7 "[ ***. *-+*]" 1 91 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 92 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 93 LYS 1.642 0.715 2 1 "[ + . 1]" 1 94 GLN 1.693 0.715 2 1 "[ + . 1]" 1 95 LYS 0.118 0.047 6 0 "[ . 1]" 1 96 GLU 6.564 1.858 9 5 "[ - * **+1]" 1 97 ALA 5.314 1.327 5 4 "[ * *+ - 1]" 1 98 LYS 11.746 1.858 9 6 "[ * ** -*+1]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 1 MET HA 1 24 LYS H 4.000 . 5.000 4.036 3.948 4.126 . 0 0 "[ . 1]" 1 2 1 1 MET HA 1 25 PHE HA 2.000 . 2.800 2.211 1.959 2.337 . 0 0 "[ . 1]" 1 3 1 1 MET HA 1 25 PHE QB 4.000 . 6.000 3.246 2.760 3.518 . 0 0 "[ . 1]" 1 4 1 1 MET HA 1 26 ASP H 3.000 . 3.500 3.682 3.644 3.713 0.213 9 0 "[ . 1]" 1 5 1 1 MET QB 1 2 ASP H 4.000 . 6.000 2.835 2.612 2.983 . 0 0 "[ . 1]" 1 6 1 1 MET QB 1 32 SER QB 4.000 . 6.000 4.767 4.600 4.931 . 0 0 "[ . 1]" 1 7 1 1 MET QG 1 24 LYS H 4.000 . 6.000 4.801 4.331 5.479 . 0 0 "[ . 1]" 1 8 1 1 MET QG 1 25 PHE HA 4.000 . 6.000 3.254 2.720 4.934 . 0 0 "[ . 1]" 1 9 1 1 MET QG 1 25 PHE QB 4.000 . 6.000 2.736 2.055 4.717 . 0 0 "[ . 1]" 1 10 1 1 MET QG 1 39 LEU MD2 4.000 . 6.000 3.674 2.582 4.307 . 0 0 "[ . 1]" 1 11 1 2 ASP HA 1 39 LEU MD2 4.000 . 6.000 4.056 3.345 4.782 . 0 0 "[ . 1]" 1 12 1 2 ASP H 1 2 ASP HB2 . . 2.800 2.891 2.693 2.953 0.153 1 0 "[ . 1]" 1 13 1 2 ASP H 1 3 LEU H 4.000 . 5.000 4.275 4.014 4.463 . 0 0 "[ . 1]" 1 14 1 2 ASP H 1 23 LEU HG 4.000 . 6.000 2.492 2.246 2.712 . 0 0 "[ . 1]" 1 15 1 2 ASP H 1 23 LEU QD 4.000 . 6.000 3.059 2.773 3.276 . 0 0 "[ . 1]" 1 16 1 2 ASP H 1 24 LYS H . . 3.500 1.793 1.725 1.858 0.075 7 0 "[ . 1]" 1 17 1 2 ASP H 1 24 LYS QD 4.000 . 6.000 4.444 4.011 4.681 . 0 0 "[ . 1]" 1 18 1 2 ASP H 1 25 PHE HA 4.000 . 5.000 3.900 3.813 3.980 . 0 0 "[ . 1]" 1 19 1 2 ASP HB3 1 3 LEU H 4.000 . 6.000 3.369 2.882 4.160 . 0 0 "[ . 1]" 1 20 1 2 ASP HB3 1 4 ILE MD 4.000 . 6.000 3.681 2.844 4.790 . 0 0 "[ . 1]" 1 21 1 2 ASP HB3 1 24 LYS QB 4.000 . 6.000 2.885 1.904 3.330 . 0 0 "[ . 1]" 1 22 1 2 ASP HB3 1 24 LYS QD 4.000 . 6.000 2.328 1.715 2.880 0.085 1 0 "[ . 1]" 1 23 1 2 ASP HB3 1 24 LYS QE 4.000 . 6.000 3.849 2.377 4.429 . 0 0 "[ . 1]" 1 24 1 2 ASP HB3 1 24 LYS QG 4.000 . 6.000 3.234 2.088 3.826 . 0 0 "[ . 1]" 1 25 1 2 ASP HB2 1 3 LEU H 4.000 . 6.000 4.106 3.729 4.581 . 0 0 "[ . 1]" 1 26 1 2 ASP HB2 1 4 ILE MD 4.000 . 6.000 4.040 3.001 4.744 . 0 0 "[ . 1]" 1 27 1 2 ASP HB2 1 24 LYS H 4.000 . 6.000 2.810 2.279 3.562 . 0 0 "[ . 1]" 1 28 1 2 ASP HB2 1 24 LYS QB 4.000 . 6.000 1.852 1.656 2.257 0.144 4 0 "[ . 1]" 1 29 1 2 ASP HB2 1 24 LYS QD 4.000 . 6.000 2.311 1.870 3.155 . 0 0 "[ . 1]" 1 30 1 2 ASP HB2 1 24 LYS QE 4.000 . 6.000 3.972 1.974 5.034 . 0 0 "[ . 1]" 1 31 1 2 ASP HB2 1 24 LYS QG 4.000 . 6.000 2.731 2.059 4.104 . 0 0 "[ . 1]" 1 32 1 5 ILE H 1 25 PHE QB 4.000 . 6.000 12.789 12.423 13.054 7.054 4 10 [***+*****-] 1 33 1 3 LEU HA 1 3 LEU MD1 4.000 . 6.000 3.195 3.112 3.290 . 0 0 "[ . 1]" 1 34 1 3 LEU HA 1 3 LEU MD2 4.000 . 6.000 1.830 1.693 1.980 0.107 8 0 "[ . 1]" 1 35 1 3 LEU HA 1 4 ILE HB 4.000 . 6.000 5.344 4.706 5.808 . 0 0 "[ . 1]" 1 36 1 3 LEU HA 1 4 ILE H 2.000 . 2.800 2.137 2.117 2.173 . 0 0 "[ . 1]" 1 37 1 3 LEU HA 1 4 ILE MD 4.000 . 6.000 3.859 2.872 4.795 . 0 0 "[ . 1]" 1 38 1 3 LEU HA 1 4 ILE HG12 4.000 . 6.000 3.909 3.685 4.298 . 0 0 "[ . 1]" 1 39 1 3 LEU HA 1 22 VAL H 4.000 . 5.000 3.793 3.705 3.946 . 0 0 "[ . 1]" 1 40 1 3 LEU HA 1 23 LEU HA 2.000 . 2.800 2.411 2.113 2.636 . 0 0 "[ . 1]" 1 41 1 3 LEU HA 1 23 LEU QD 4.000 . 6.000 3.704 3.189 4.016 . 0 0 "[ . 1]" 1 42 1 3 LEU HA 1 24 LYS H 3.000 . 3.500 3.640 3.542 3.707 0.207 2 0 "[ . 1]" 1 43 1 3 LEU HA 1 24 LYS QE 4.000 . 6.000 5.242 3.737 5.483 . 0 0 "[ . 1]" 1 44 1 3 LEU H 1 3 LEU MD1 4.000 . 6.000 4.422 4.186 4.619 . 0 0 "[ . 1]" 1 45 1 3 LEU H 1 3 LEU MD2 4.000 . 6.000 3.908 3.690 4.109 . 0 0 "[ . 1]" 1 46 1 3 LEU H 1 4 ILE H 4.000 . 5.000 4.330 4.260 4.389 . 0 0 "[ . 1]" 1 47 1 3 LEU H 1 24 LYS QD 4.000 . 6.000 4.857 4.095 5.170 . 0 0 "[ . 1]" 1 48 1 3 LEU HB3 1 23 LEU HA 4.000 . 6.000 5.100 4.612 5.432 . 0 0 "[ . 1]" 1 49 1 3 LEU HB2 1 4 ILE HA 4.000 . 6.000 5.685 5.574 5.806 . 0 0 "[ . 1]" 1 50 1 3 LEU HB2 1 4 ILE H 4.000 . 6.000 4.502 4.431 4.560 . 0 0 "[ . 1]" 1 51 1 3 LEU HB2 1 24 LYS H 4.000 . 6.000 5.253 4.777 5.564 . 0 0 "[ . 1]" 1 52 1 3 LEU MD1 1 4 ILE HA 4.000 . 6.000 3.976 3.457 4.450 . 0 0 "[ . 1]" 1 53 1 3 LEU MD1 1 39 LEU HA 4.000 . 6.000 4.895 4.815 4.949 . 0 0 "[ . 1]" 1 54 1 3 LEU MD1 1 40 ILE HA 4.000 . 6.000 1.871 1.732 2.156 0.068 8 0 "[ . 1]" 1 55 1 3 LEU MD1 1 40 ILE QG 4.000 . 6.000 4.147 2.959 4.388 . 0 0 "[ . 1]" 1 56 1 3 LEU MD1 1 43 HIS QB 4.000 . 6.000 1.858 1.664 2.231 0.136 2 0 "[ . 1]" 1 57 1 3 LEU MD2 1 4 ILE HA 4.000 . 6.000 4.660 4.142 4.931 . 0 0 "[ . 1]" 1 58 1 3 LEU MD2 1 4 ILE H 4.000 . 6.000 2.598 2.324 2.873 . 0 0 "[ . 1]" 1 59 1 3 LEU MD2 1 4 ILE HG12 4.000 . 6.000 4.169 3.640 4.638 . 0 0 "[ . 1]" 1 60 1 3 LEU MD2 1 21 TYR HA 4.000 . 6.000 3.641 2.919 4.193 . 0 0 "[ . 1]" 1 61 1 3 LEU MD2 1 23 LEU HA 4.000 . 6.000 2.296 2.059 2.672 . 0 0 "[ . 1]" 1 62 1 3 LEU MD2 1 23 LEU QB 4.000 . 6.000 2.442 2.030 2.845 . 0 0 "[ . 1]" 1 63 1 3 LEU MD2 1 23 LEU QD 4.000 . 6.000 2.454 1.970 2.914 . 0 0 "[ . 1]" 1 64 1 3 LEU MD2 1 39 LEU MD2 4.000 . 6.000 2.364 1.740 3.245 0.060 9 0 "[ . 1]" 1 65 1 3 LEU MD2 1 40 ILE HA 4.000 . 6.000 2.945 2.410 3.630 . 0 0 "[ . 1]" 1 66 1 3 LEU MD2 1 40 ILE MD 4.000 . 6.000 3.915 3.822 3.968 . 0 0 "[ . 1]" 1 67 1 4 ILE HA 1 5 ILE H . . 2.800 2.086 1.990 2.153 . 0 0 "[ . 1]" 1 68 1 4 ILE H 1 4 ILE HB 4.000 . 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