NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
432138 | 2jrr | 15341 | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_2jrr save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 963 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 687 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 955.188 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.472 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0188 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0025 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0695 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 2 THR 2.422 0.305 8 0 "[ . 1 . 2]" 1 3 ILE 0.975 0.305 8 0 "[ . 1 . 2]" 1 4 GLN 1.916 0.170 12 0 "[ . 1 . 2]" 1 5 ALA 0.964 0.139 13 0 "[ . 1 . 2]" 1 6 PRO 0.597 0.103 12 0 "[ . 1 . 2]" 1 7 GLU 2.384 0.435 10 0 "[ . 1 . 2]" 1 8 THR 1.701 0.435 10 0 "[ . 1 . 2]" 1 9 LYS 3.167 0.163 8 0 "[ . 1 . 2]" 1 10 ILE 1.031 0.129 20 0 "[ . 1 . 2]" 1 11 VAL 0.578 0.118 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 12 ASP 1.213 0.120 13 0 "[ . 1 . 2]" 1 13 LYS 1.109 0.120 13 0 "[ . 1 . 2]" 1 14 SER 1.716 0.211 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 15 ARG 1.732 0.213 13 0 "[ . 1 . 2]" 1 16 VAL 1.514 0.213 13 0 "[ . 1 . 2]" 1 17 ALA 0.642 0.110 3 0 "[ . 1 . 2]" 1 18 CYS 0.382 0.087 11 0 "[ . 1 . 2]" 1 19 ASP 0.401 0.210 12 0 "[ . 1 . 2]" 1 20 GLY 1.123 0.172 5 0 "[ . 1 . 2]" 1 21 GLY 1.303 0.106 9 0 "[ . 1 . 2]" 1 22 GLU 0.588 0.080 8 0 "[ . 1 . 2]" 1 23 GLY 0.149 0.080 8 0 "[ . 1 . 2]" 1 24 ALA 0.341 0.160 8 0 "[ . 1 . 2]" 1 25 LEU 1.429 0.160 8 0 "[ . 1 . 2]" 1 26 GLY 1.247 0.126 6 0 "[ . 1 . 2]" 1 27 HIS 2.265 0.210 12 0 "[ . 1 . 2]" 1 28 PRO 0.706 0.089 14 0 "[ . 1 . 2]" 1 29 ARG 18.455 0.472 20 0 "[ . 1 . 2]" 1 30 VAL 10.970 0.417 20 0 "[ . 1 . 2]" 1 31 TRP 1.197 0.269 5 0 "[ . 1 . 2]" 1 32 LEU 0.145 0.063 20 0 "[ . 1 . 2]" 1 33 GLN 2.343 0.211 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 34 ILE 1.740 0.094 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 35 PRO 1.990 0.103 14 0 "[ . 1 . 2]" 1 36 GLU 0.014 0.011 9 0 "[ . 1 . 2]" 1 37 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ . 1 . 2]" 1 38 THR 1.603 0.103 14 0 "[ . 1 . 2]" 1 39 GLY 0.014 0.011 9 0 "[ . 1 . 2]" 1 40 TRP 0.819 0.077 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 41 VAL 2.442 0.191 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 42 GLU 0.103 0.048 3 0 "[ . 1 . 2]" 1 43 CYS 0.554 0.077 12 0 "[ . 1 . 2]" 1 44 PRO 0.142 0.063 20 0 "[ . 1 . 2]" 1 45 TYR 0.386 0.070 6 0 "[ . 1 . 2]" 1 46 CYS 0.946 0.154 1 0 "[ . 1 . 2]" 1 47 ASP 0.786 0.098 9 0 "[ . 1 . 2]" 1 48 CYS 0.437 0.077 12 0 "[ . 1 . 2]" 1 49 LYS 0.077 0.048 3 0 "[ . 1 . 2]" 1 50 TYR 1.761 0.191 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 51 VAL 2.394 0.163 8 0 "[ . 1 . 2]" 1 52 LEU 0.410 0.048 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 53 LYS 0.085 0.046 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 54 GLY 0.107 0.060 4 0 "[ . 1 . 2]" 1 55 SER 0.151 0.049 19 0 "[ . 1 . 2]" 1 56 LYS 0.332 0.074 9 0 "[ . 1 . 2]" 1 57 ALA 0.853 0.239 5 0 "[ . 1 . 2]" 1 58 ASP 0.714 0.239 5 0 "[ . 1 . 2]" 1 59 ALA 0.559 0.080 17 0 "[ . 1 . 2]" 1 60 LEU 0.588 0.080 17 0 "[ . 1 . 2]" 1 61 GLU 0.150 0.066 12 0 "[ . 1 . 2]" 1 62 HIS 0.922 0.190 7 0 "[ . 1 . 2]" 1 63 HIS 0.891 0.190 7 0 "[ . 1 . 2]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 2 THR HA 1 3 ILE H 4.000 . 5.000 2.660 2.181 3.523 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 2 1 2 THR HA 1 3 ILE HA 4.000 . 5.000 4.691 4.357 5.305 0.305 8 0 "[ . 1 . 2]" 1 3 1 2 THR HB 1 3 ILE H 4.000 . 5.000 3.301 2.169 4.202 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 4 1 2 THR HB 1 4 GLN H 3.000 . 3.500 2.655 2.171 3.544 0.044 19 0 "[ . 1 . 2]" 1 5 1 2 THR HB 1 4 GLN HA 3.000 . 3.500 3.568 3.396 3.670 0.170 12 0 "[ . 1 . 2]" 1 6 1 2 THR MG 1 4 GLN HA 4.000 . 6.000 4.376 2.512 5.014 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 7 1 3 ILE H 1 3 ILE HB 4.000 . 5.000 3.343 2.411 4.013 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 8 1 3 ILE H 1 3 ILE HG12 4.000 . 5.000 3.334 1.958 4.701 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 9 1 3 ILE H 1 3 ILE HG13 4.000 . 5.000 3.314 2.032 4.537 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 10 1 3 ILE H 1 3 ILE MG 4.000 . 6.000 3.158 2.117 4.163 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 11 1 3 ILE H 1 3 ILE MD 4.000 . 6.000 3.546 1.757 4.467 0.043 10 0 "[ . 1 . 2]" 1 12 1 3 ILE HA 1 3 ILE HG12 4.000 . 5.000 3.323 2.526 4.263 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 13 1 3 ILE HA 1 3 ILE HG13 4.000 . 5.000 3.325 2.363 4.282 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 14 1 3 ILE HA 1 4 GLN H 3.000 . 3.500 3.245 2.276 3.536 0.036 7 0 "[ . 1 . 2]" 1 15 1 3 ILE HA 1 4 GLN QG 4.000 . 6.000 4.057 3.487 5.869 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 16 1 3 ILE HB 1 4 GLN H 4.000 . 5.000 3.716 2.648 4.461 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 17 1 3 ILE MD 1 5 ALA MB 4.000 . 7.000 4.223 2.545 5.518 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 18 1 4 GLN H 1 4 GLN HB2 4.000 . 5.000 3.542 2.646 3.957 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 19 1 4 GLN H 1 4 GLN HB3 4.000 . 5.000 3.863 2.707 4.123 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 20 1 4 GLN H 1 4 GLN HG2 4.000 . 5.000 3.488 1.875 4.449 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 21 1 4 GLN H 1 4 GLN HG3 4.000 . 5.000 3.387 1.883 5.062 0.062 5 0 "[ . 1 . 2]" 1 22 1 4 GLN HA 1 4 GLN HG2 4.000 . 5.000 2.827 2.337 3.813 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 23 1 4 GLN HA 1 4 GLN HG3 4.000 . 5.000 3.257 2.504 3.792 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 24 1 4 GLN HA 1 5 ALA H 3.000 . 3.500 2.996 2.157 3.564 0.064 20 0 "[ . 1 . 2]" 1 25 1 4 GLN HA 1 5 ALA MB 4.000 . 6.000 4.404 3.840 4.821 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 26 1 4 GLN HA 1 6 PRO QD 4.000 . 6.000 4.013 3.079 5.719 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 27 1 4 GLN HB2 1 5 ALA H 4.000 . 5.000 3.500 1.876 4.577 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 28 1 4 GLN HB3 1 5 ALA H 4.000 . 5.000 3.725 1.905 4.589 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 29 1 4 GLN QB 1 5 ALA HA 4.000 . 6.000 4.283 3.764 4.785 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 30 1 4 GLN QG 1 5 ALA H 4.000 . 6.000 4.120 3.545 4.953 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 31 1 5 ALA H 1 6 PRO QG 4.000 . 6.000 4.415 3.127 5.867 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 32 1 5 ALA H 1 6 PRO HD2 4.000 . 5.000 3.753 1.760 5.051 0.051 18 0 "[ . 1 . 2]" 1 33 1 5 ALA H 1 6 PRO HD3 4.000 . 5.000 2.896 2.195 4.221 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 34 1 5 ALA HA 1 6 PRO HA 4.000 . 5.000 4.678 4.543 5.017 0.017 6 0 "[ . 1 . 2]" 1 35 1 5 ALA HA 1 6 PRO QG 4.000 . 6.000 4.284 3.924 5.402 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 36 1 5 ALA HA 1 6 PRO HD2 4.000 . 5.000 2.739 2.079 4.170 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 37 1 5 ALA HA 1 6 PRO HD3 4.000 . 5.000 2.762 2.123 4.092 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 38 1 5 ALA HA 1 7 GLU H 4.000 . 5.000 4.441 3.536 5.139 0.139 13 0 "[ . 1 . 2]" 1 39 1 5 ALA MB 1 6 PRO HD2 4.000 . 6.000 3.814 2.851 4.361 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 40 1 5 ALA MB 1 6 PRO HD3 4.000 . 6.000 3.623 1.770 4.224 0.030 12 0 "[ . 1 . 2]" 1 41 1 6 PRO HA 1 7 GLU H 2.500 . 2.900 2.585 2.226 3.003 0.103 12 0 "[ . 1 . 2]" 1 42 1 6 PRO QB 1 7 GLU H 4.000 . 6.000 3.905 3.753 4.024 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 43 1 7 GLU H 1 7 GLU HG2 4.000 . 5.000 3.819 1.835 4.984 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 44 1 7 GLU H 1 7 GLU HG3 4.000 . 5.000 3.759 1.844 5.048 0.048 15 0 "[ . 1 . 2]" 1 45 1 7 GLU HA 1 8 THR H 2.500 . 2.900 2.485 2.120 3.335 0.435 10 0 "[ . 1 . 2]" 1 46 1 7 GLU QB 1 8 THR H 4.000 . 6.000 3.672 2.106 4.016 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 47 1 7 GLU HG2 1 8 THR H 4.000 . 5.000 4.087 2.809 5.095 0.095 19 0 "[ . 1 . 2]" 1 48 1 7 GLU HG3 1 8 THR H 4.000 . 5.000 4.076 2.214 5.094 0.094 5 0 "[ . 1 . 2]" 1 49 1 8 THR H 1 8 THR HB 3.000 . 3.500 2.665 2.428 3.642 0.142 9 0 "[ . 1 . 2]" 1 50 1 8 THR H 1 8 THR MG 4.000 . 6.000 3.695 2.476 3.894 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 51 1 8 THR H 1 9 LYS H 4.000 . 5.000 4.460 4.189 4.583 . 0 0 "[ . 1 . 2]" 1 52 1 8 THR HA 1 9 LYS H 3.000 . 3.500 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