NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
429253 | 2j4n | 7285 | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_2j4n save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 1410 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 915 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 168.289 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.284 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0147 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0033 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0307 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 2 MET 0.584 0.095 6 0 "[ . ]" 1 3 ALA 1.151 0.178 2 0 "[ . ]" 1 4 CYS 0.346 0.062 2 0 "[ . ]" 1 5 TRP 0.213 0.037 4 0 "[ . ]" 1 6 ALA 0.287 0.061 6 0 "[ . ]" 1 7 GLN 0.479 0.062 2 0 "[ . ]" 1 8 SER 0.000 0.000 . 0 "[ . ]" 1 9 GLN 0.092 0.035 4 0 "[ . ]" 1 10 GLY 0.071 0.030 4 0 "[ . ]" 1 11 TYR 0.654 0.074 4 0 "[ . ]" 1 12 ASN 0.108 0.037 4 0 "[ . ]" 1 13 CYS 0.456 0.085 5 0 "[ . ]" 1 14 CYS 0.410 0.154 5 0 "[ . ]" 1 15 ASN 0.798 0.154 5 0 "[ . ]" 1 16 ASN 0.437 0.063 2 0 "[ . ]" 1 17 PRO 0.047 0.022 4 0 "[ . ]" 1 18 SER 0.305 0.072 3 0 "[ . ]" 1 19 SER 0.433 0.104 4 0 "[ . ]" 1 20 THR 2.261 0.185 5 0 "[ . ]" 1 21 LYS 0.096 0.023 2 0 "[ . ]" 1 22 VAL 2.046 0.261 4 0 "[ . ]" 1 23 GLU 0.379 0.048 6 0 "[ . ]" 1 24 TYR 1.679 0.261 4 0 "[ . ]" 1 25 THR 0.384 0.045 2 0 "[ . ]" 1 26 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ . ]" 1 27 ALA 0.432 0.085 5 0 "[ . ]" 1 28 SER 0.238 0.045 2 0 "[ . ]" 1 29 GLY 0.317 0.085 5 0 "[ . ]" 1 30 GLN 0.589 0.121 4 0 "[ . ]" 1 31 TRP 0.433 0.068 4 0 "[ . ]" 1 32 GLY 0.121 0.048 6 0 "[ . ]" 1 33 VAL 0.423 0.048 4 0 "[ . ]" 1 34 GLN 1.048 0.072 3 0 "[ . ]" 1 35 ASN 0.680 0.056 1 0 "[ . ]" 1 36 GLY 0.025 0.023 4 0 "[ . ]" 1 37 GLN 0.160 0.031 4 0 "[ . ]" 1 38 TRP 0.603 0.124 6 0 "[ . ]" 1 39 CYS 0.191 0.050 2 0 "[ . ]" 1 40 GLY 0.075 0.068 4 0 "[ . ]" 1 41 ILE 1.564 0.124 4 0 "[ . ]" 1 42 ASP 0.329 0.071 2 0 "[ . ]" 1 43 TYR 0.422 0.055 3 0 "[ . ]" 1 44 SER 0.740 0.175 2 0 "[ . ]" 1 45 TYR 2.359 0.178 2 0 "[ . ]" 1 46 GLY 0.733 0.177 3 0 "[ . ]" 1 47 GLN 0.776 0.137 3 0 "[ . ]" 1 48 ASN 0.001 0.001 3 0 "[ . ]" 1 49 GLN 1.200 0.284 6 0 "[ . ]" 1 50 GLY 0.570 0.284 6 0 "[ . ]" 1 51 ASN 0.371 0.092 6 0 "[ . ]" 1 52 GLU 0.045 0.017 3 0 "[ . ]" 1 53 SER 0.193 0.043 5 0 "[ . ]" 1 54 CYS 0.065 0.017 2 0 "[ . ]" 1 55 THR 1.274 0.124 1 0 "[ . ]" 1 56 GLY 0.138 0.060 6 0 "[ . ]" 1 57 ASN 0.350 0.124 1 0 "[ . ]" 1 58 GLY 0.576 0.071 5 0 "[ . ]" 1 59 SER 0.210 0.052 6 0 "[ . ]" 1 60 TYR 0.259 0.042 5 0 "[ . ]" 1 61 PRO 0.181 0.050 6 0 "[ . ]" 1 62 CYS 0.189 0.047 4 0 "[ . ]" 1 63 CYS 0.741 0.146 6 0 "[ . ]" 1 64 ASN 0.585 0.059 3 0 "[ . ]" 1 65 THR 0.746 0.059 3 0 "[ . ]" 1 66 CYS 0.389 0.039 5 0 "[ . ]" 1 67 GLN 0.512 0.072 5 0 "[ . ]" 1 68 ALA 1.497 0.142 6 0 "[ . ]" 1 69 THR 1.943 0.142 6 0 "[ . ]" 1 70 TYR 1.094 0.064 6 0 "[ . ]" 1 71 THR 0.849 0.053 2 0 "[ . ]" 1 72 ASP 0.270 0.053 2 0 "[ . ]" 1 73 GLY 0.007 0.007 4 0 "[ . ]" 1 74 ASP 0.532 0.097 2 0 "[ . ]" 1 75 GLY 0.185 0.036 4 0 "[ . ]" 1 76 ASP 0.455 0.059 6 0 "[ . ]" 1 77 TRP 1.568 0.097 2 0 "[ . ]" 1 78 ALA 1.887 0.083 6 0 "[ . ]" 1 79 PHE 0.037 0.029 4 0 "[ . ]" 1 80 GLU 0.638 0.077 2 0 "[ . ]" 1 81 ASN 0.071 0.071 3 0 "[ . ]" 1 82 GLY 0.008 0.006 3 0 "[ . ]" 1 83 ASN 0.331 0.077 2 0 "[ . ]" 1 84 TRP 0.098 0.034 2 0 "[ . ]" 1 85 CYS 0.495 0.146 6 0 "[ . ]" 1 86 GLY 0.397 0.047 4 0 "[ . ]" 1 87 ILE 1.906 0.149 4 0 "[ . ]" 1 88 LYS 0.550 0.149 4 0 "[ . ]" 1 89 ASN 0.185 0.052 5 0 "[ . ]" 1 90 SER 0.377 0.073 5 0 "[ . ]" 1 91 CYS 0.579 0.079 3 0 "[ . ]" 1 92 LYS 1.406 0.129 5 0 "[ . ]" 1 93 GLN 0.599 0.127 5 0 "[ . ]" 1 94 GLN 0.733 0.134 4 0 "[ . ]" 1 95 PRO 0.659 0.134 4 0 "[ . ]" 1 96 GLN 0.348 0.077 5 0 "[ . ]" 1 97 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ . ]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 2 MET HA 1 2 MET ME 5.000 . 5.000 3.163 2.658 3.914 . 0 0 "[ . ]" 1 2 1 2 MET HA 1 3 ALA MB 5.000 . 5.000 4.079 3.694 4.205 . 0 0 "[ . ]" 1 3 1 2 MET HA 1 3 ALA H 3.500 . 3.500 2.294 2.141 2.561 . 0 0 "[ . ]" 1 4 1 2 MET QB 1 3 ALA H 5.000 . 5.000 3.526 2.003 3.969 . 0 0 "[ . ]" 1 5 1 2 MET ME 1 3 ALA H 5.000 . 5.000 4.979 4.772 5.095 0.095 6 0 "[ . ]" 1 6 1 2 MET QG 1 3 ALA MB 5.000 . 5.000 4.730 4.187 5.014 0.014 2 0 "[ . ]" 1 7 1 2 MET QG 1 3 ALA H 5.000 . 5.000 3.927 3.485 4.464 . 0 0 "[ . ]" 1 8 1 2 MET HA 1 4 CYS H 5.000 . 5.000 3.687 3.490 4.505 . 0 0 "[ . ]" 1 9 1 2 MET QB 1 7 GLN QE 5.000 . 5.000 3.749 2.424 4.596 . 0 0 "[ . ]" 1 10 1 2 MET QB 1 45 TYR QD 5.000 . 5.000 4.430 2.781 4.990 . 0 0 "[ . ]" 1 11 1 2 MET QB 1 45 TYR QE 5.000 . 5.000 3.875 2.894 4.664 . 0 0 "[ . ]" 1 12 1 2 MET ME 1 45 TYR QE 5.000 . 5.000 3.937 2.985 5.015 0.015 5 0 "[ . ]" 1 13 1 2 MET QG 1 45 TYR QE 5.000 . 5.000 4.038 2.286 5.020 0.020 6 0 "[ . ]" 1 14 1 2 MET H 1 47 GLN HA 5.000 . 5.000 4.876 4.518 5.049 0.049 2 0 "[ . ]" 1 15 1 2 MET H 1 47 GLN QG 5.000 . 5.000 5.043 5.016 5.067 0.067 3 0 "[ . ]" 1 16 1 3 ALA H 1 3 ALA MB 3.500 . 3.500 2.747 2.634 2.798 . 0 0 "[ . ]" 1 17 1 3 ALA HA 1 4 CYS HA 5.000 . 5.000 4.713 4.604 4.882 . 0 0 "[ . ]" 1 18 1 3 ALA HA 1 4 CYS H 3.500 . 3.500 2.904 2.892 2.924 . 0 0 "[ . ]" 1 19 1 3 ALA MB 1 4 CYS HA 5.000 . 5.000 4.190 4.094 4.384 . 0 0 "[ . ]" 1 20 1 3 ALA MB 1 4 CYS H 5.000 . 5.000 3.630 3.618 3.638 . 0 0 "[ . ]" 1 21 1 3 ALA H 1 4 CYS H 5.000 . 5.000 2.106 2.041 2.338 . 0 0 "[ . ]" 1 22 1 3 ALA MB 1 7 GLN QE 5.000 . 5.000 4.755 3.903 5.039 0.039 2 0 "[ . ]" 1 23 1 3 ALA MB 1 7 GLN QG 5.000 . 5.000 4.998 4.925 5.027 0.027 1 0 "[ . ]" 1 24 1 3 ALA MB 1 44 SER QB 5.000 . 5.000 5.077 5.031 5.175 0.175 2 0 "[ . ]" 1 25 1 3 ALA MB 1 45 TYR QB 5.000 . 5.000 3.540 1.870 4.502 . 0 0 "[ . ]" 1 26 1 3 ALA MB 1 45 TYR QD 5.000 . 5.000 3.701 3.283 3.986 . 0 0 "[ . ]" 1 27 1 3 ALA MB 1 45 TYR QE 5.000 . 5.000 5.041 4.826 5.178 0.178 2 0 "[ . ]" 1 28 1 3 ALA H 1 45 TYR QD 5.000 . 5.000 2.265 1.837 2.688 . 0 0 "[ . ]" 1 29 1 4 CYS HA 1 5 TRP HD1 5.000 . 5.000 4.170 3.904 4.455 . 0 0 "[ . ]" 1 30 1 4 CYS HA 1 5 TRP H 5.000 . 5.000 2.300 2.227 2.388 . 0 0 "[ . ]" 1 31 1 4 CYS H 1 5 TRP H 5.000 . 5.000 4.528 4.170 4.613 . 0 0 "[ . ]" 1 32 1 4 CYS HA 1 6 ALA MB 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