NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | in_recoord | stage | program | type | subtype | subsubtype |
377673 | 1gd4 | 4828 | cing | recoord | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1gd4 save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 1763 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 225 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 25.023 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.469 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0514 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0142 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.1112 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 3 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 4 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 5 GLY 0.510 0.243 1 0 "[ ]" 1 6 LEU 0.578 0.441 1 0 "[ ]" 1 7 SER 0.942 0.441 1 0 "[ ]" 1 8 GLU 0.660 0.352 1 0 "[ ]" 1 9 ALA 0.799 0.362 1 0 "[ ]" 1 10 LYS 0.593 0.368 1 0 "[ ]" 1 11 PRO 0.144 0.144 1 0 "[ ]" 1 12 ALA 0.176 0.144 1 0 "[ ]" 1 13 THR 0.362 0.230 1 0 "[ ]" 1 14 PRO 0.114 0.114 1 0 "[ ]" 1 15 GLU 1.561 0.432 1 0 "[ ]" 1 16 ILE 0.915 0.432 1 0 "[ ]" 1 17 GLN 1.230 0.285 1 0 "[ ]" 1 18 GLU 1.833 0.308 1 0 "[ ]" 1 19 ILE 0.690 0.249 1 0 "[ ]" 1 20 VAL 1.026 0.308 1 0 "[ ]" 1 21 ASP 0.208 0.063 1 0 "[ ]" 1 22 LYS 0.657 0.345 1 0 "[ ]" 1 23 VAL 0.788 0.330 1 0 "[ ]" 1 24 LYS 0.301 0.249 1 0 "[ ]" 1 25 SER 0.319 0.113 1 0 "[ ]" 1 26 GLN 0.147 0.044 1 0 "[ ]" 1 27 LEU 0.762 0.330 1 0 "[ ]" 1 28 GLU 0.465 0.188 1 0 "[ ]" 1 29 GLU 0.177 0.120 1 0 "[ ]" 1 30 LYS 0.726 0.361 1 0 "[ ]" 1 31 THR 0.391 0.273 1 0 "[ ]" 1 32 ASN 0.730 0.273 1 0 "[ ]" 1 33 GLU 0.208 0.104 1 0 "[ ]" 1 34 THR 0.494 0.188 1 0 "[ ]" 1 35 TYR 0.208 0.082 1 0 "[ ]" 1 36 GLY 0.145 0.093 1 0 "[ ]" 1 37 LYS 0.197 0.171 1 0 "[ ]" 1 38 LEU 0.591 0.171 1 0 "[ ]" 1 39 GLU 0.208 0.086 1 0 "[ ]" 1 40 ALA 0.322 0.103 1 0 "[ ]" 1 41 VAL 0.387 0.230 1 0 "[ ]" 1 42 GLN 0.887 0.368 1 0 "[ ]" 1 43 TYR 0.994 0.362 1 0 "[ ]" 1 44 LYS 0.289 0.289 1 0 "[ ]" 1 45 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 46 GLN 0.436 0.218 1 0 "[ ]" 1 47 VAL 0.359 0.218 1 0 "[ ]" 1 48 VAL 0.439 0.328 1 0 "[ ]" 1 49 ALA 0.328 0.328 1 0 "[ ]" 1 50 GLY 0.218 0.218 1 0 "[ ]" 1 51 THR 0.324 0.218 1 0 "[ ]" 1 52 ASN 0.791 0.469 1 0 "[ ]" 1 53 TYR 0.193 0.085 1 0 "[ ]" 1 54 TYR 0.089 0.068 1 0 "[ ]" 1 55 ILE 0.193 0.173 1 0 "[ ]" 1 56 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 57 VAL 0.406 0.173 1 0 "[ ]" 1 58 ARG 0.559 0.182 1 0 "[ ]" 1 59 ALA 0.254 0.182 1 0 "[ ]" 1 60 GLY 0.588 0.315 1 0 "[ ]" 1 61 ASP 0.721 0.315 1 0 "[ ]" 1 62 ASN 0.446 0.200 1 0 "[ ]" 1 63 LYS 0.055 0.055 1 0 "[ ]" 1 64 TYR 0.638 0.349 1 0 "[ ]" 1 65 LEU 0.559 0.349 1 0 "[ ]" 1 66 HIS 0.118 0.089 1 0 "[ ]" 1 67 LEU 0.439 0.169 1 0 "[ ]" 1 68 LYS 0.821 0.193 1 0 "[ ]" 1 69 VAL 0.060 0.032 1 0 "[ ]" 1 70 PHE 0.893 0.262 1 0 "[ ]" 1 71 LYS 0.542 0.469 1 0 "[ ]" 1 72 SER 0.444 0.184 1 0 "[ ]" 1 73 LEU 0.266 0.148 1 0 "[ ]" 1 74 PRO 0.433 0.184 1 0 "[ ]" 1 75 GLY 0.224 0.224 1 0 "[ ]" 1 76 GLN 1.040 0.359 1 0 "[ ]" 1 77 ASN 1.192 0.359 1 0 "[ ]" 1 78 GLU 1.010 0.242 1 0 "[ ]" 1 79 ASP 0.714 0.451 1 0 "[ ]" 1 80 LEU 0.323 0.203 1 0 "[ ]" 1 81 VAL 0.448 0.171 1 0 "[ ]" 1 82 LEU 0.145 0.073 1 0 "[ ]" 1 83 THR 0.117 0.117 1 0 "[ ]" 1 84 GLY 0.154 0.144 1 0 "[ ]" 1 85 TYR 0.311 0.152 1 0 "[ ]" 1 86 GLN 0.180 0.145 1 0 "[ ]" 1 87 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 88 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 89 LYS 0.355 0.164 1 0 "[ ]" 1 90 ASN 0.094 0.089 1 0 "[ ]" 1 91 LYS 0.355 0.089 1 0 "[ ]" 1 92 ASP 0.522 0.164 1 0 "[ ]" 1 93 ASP 0.117 0.097 1 0 "[ ]" 1 94 GLU 0.481 0.182 1 0 "[ ]" 1 95 LEU 0.581 0.182 1 0 "[ ]" 1 96 THR 0.355 0.156 1 0 "[ ]" 1 97 GLY 0.083 0.083 1 0 "[ ]" 1 98 PHE 0.235 0.156 1 0 "[ ]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 3 PRO HA 1 4 GLY H 2.700 . 2.900 2.756 2.756 2.756 . 0 0 "[ ]" 1 2 1 3 PRO HB2 1 4 GLY H 4.000 . 5.000 2.013 2.013 2.013 . 0 0 "[ ]" 1 3 1 3 PRO HB3 1 4 GLY H 4.000 . 5.000 3.253 3.253 3.253 . 0 0 "[ ]" 1 4 1 4 GLY H 1 5 GLY H 3.000 . 3.500 3.407 3.407 3.407 . 0 0 "[ ]" 1 5 1 4 GLY H 1 5 GLY QA 5.000 . 8.000 4.301 4.301 4.301 . 0 0 "[ ]" 1 6 1 5 GLY H 1 5 GLY HA2 2.700 . 2.900 2.389 2.389 2.389 . 0 0 "[ ]" 1 7 1 5 GLY H 1 5 GLY HA3 2.700 . 2.900 2.944 2.944 2.944 0.044 1 0 "[ ]" 1 8 1 5 GLY HA2 1 6 LEU H 2.700 . 2.900 2.903 2.903 2.903 0.003 1 0 "[ ]" 1 9 1 5 GLY HA2 1 7 SER HA 4.000 . 5.000 5.243 5.243 5.243 0.243 1 0 "[ ]" 1 10 1 5 GLY HA3 1 6 LEU H 2.700 . 3.900 3.587 3.587 3.587 . 0 0 "[ ]" 1 11 1 5 GLY HA3 1 7 SER HA 4.000 . 5.000 5.220 5.220 5.220 0.220 1 0 "[ ]" 1 12 1 5 GLY QA 1 6 LEU H 2.700 . 3.900 2.786 2.786 2.786 . 0 0 "[ ]" 1 13 1 5 GLY QA 1 7 SER HA 4.000 . 6.000 4.661 4.661 4.661 . 0 0 "[ ]" 1 14 1 6 LEU H 1 6 LEU HB2 2.700 . 3.900 3.562 3.562 3.562 . 0 0 "[ ]" 1 15 1 6 LEU H 1 6 LEU HB3 2.700 . 2.900 2.991 2.991 2.991 0.091 1 0 "[ ]" 1 16 1 6 LEU H 1 6 LEU MD1 5.000 . 8.500 3.561 3.561 3.561 . 0 0 "[ ]" 1 17 1 6 LEU H 1 6 LEU MD2 5.000 . 8.500 1.923 1.923 1.923 . 0 0 "[ ]" 1 18 1 6 LEU H 1 7 SER H 4.000 . 5.000 4.421 4.421 4.421 . 0 0 "[ ]" 1 19 1 6 LEU H 1 46 GLN QE 5.000 . 7.000 3.503 3.503 3.503 . 0 0 "[ ]" 1 20 1 6 LEU HA 1 7 SER H 2.700 . 2.900 2.085 2.085 2.085 . 0 0 "[ ]" 1 21 1 6 LEU HA 1 46 GLN HB2 4.000 . 5.000 3.182 3.182 3.182 . 0 0 "[ ]" 1 22 1 6 LEU HA 1 46 GLN HB3 4.000 . 5.000 4.878 4.878 4.878 . 0 0 "[ ]" 1 23 1 6 LEU HB2 1 7 SER H 3.000 . 3.500 3.538 3.538 3.538 0.038 1 0 "[ ]" 1 24 1 6 LEU HB2 1 8 GLU HA 4.000 . 5.000 5.005 5.005 5.005 0.005 1 0 "[ ]" 1 25 1 6 LEU HB2 1 44 LYS HB3 4.000 . 5.000 3.102 3.102 3.102 . 0 0 "[ ]" 1 26 1 6 LEU HB3 1 7 SER H 3.000 . 3.500 3.941 3.941 3.941 0.441 1 0 "[ ]" 1 27 1 6 LEU HB3 1 44 LYS HB3 5.000 . 7.000 3.894 3.894 3.894 . 0 0 "[ ]" 1 28 1 6 LEU MD1 1 7 SER H 5.000 . 8.500 4.979 4.979 4.979 . 0 0 "[ ]" 1 29 1 6 LEU MD1 1 44 LYS HB3 5.000 . 8.500 4.373 4.373 4.373 . 0 0 "[ ]" 1 30 1 6 LEU MD1 1 46 GLN HE21 5.000 . 8.500 6.033 6.033 6.033 . 0 0 "[ ]" 1 31 1 6 LEU MD1 1 46 GLN HE22 5.000 . 8.500 6.652 6.652 6.652 . 0 0 "[ ]" 1 32 1 6 LEU MD1 1 54 TYR QD 5.000 . 10.500 4.605 4.605 4.605 . 0 0 "[ ]" 1 33 1 6 LEU MD1 1 54 TYR QE 5.000 . 11.500 5.333 5.333 5.333 . 0 0 "[ ]" 1 34 1 6 LEU MD1 1 96 THR HA 5.000 . 8.500 5.325 5.325 5.325 . 0 0 "[ ]" 1 35 1 6 LEU MD1 1 97 GLY H 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