NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype | item_count |
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524069 |
2lgp   |
16480 | cing | 2-parsed | STAR | distance | NOE | ambi | 2818 |
data_2lgp_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2lgp
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2lgp 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2lgp
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2lgp "Master copy" parsed_2lgp
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2lgp
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2lgp.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2lgp 1
1 2lgp.mr . . XPLOR/CNS 2 distance "general distance" simple 12 parsed_2lgp 1
1 2lgp.mr . . XPLOR/CNS 3 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 50 parsed_2lgp 1
1 2lgp.mr . . XPLOR/CNS 4 distance "general distance" simple 26 parsed_2lgp 1
1 2lgp.mr . . XPLOR/CNS 5 distance "hydrogen bond" simple 12 parsed_2lgp 1
1 2lgp.mr . . XPLOR/CNS 6 distance NOE ambi 2818 parsed_2lgp 1
1 2lgp.mr . . XPLOR/CNS 7 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2lgp 1
1 2lgp.mr . . "MR format" 8 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2lgp 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_6
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2lgp
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 6
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 2 . OR parsed_2lgp 1
1 2 . 3 . parsed_2lgp 1
1 3 . . . parsed_2lgp 1
2 1 . . . parsed_2lgp 1
3 1 2 . OR parsed_2lgp 1
3 2 . 3 . parsed_2lgp 1
3 3 . . . parsed_2lgp 1
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4 3 . . . parsed_2lgp 1
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5 3 . . . parsed_2lgp 1
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23 3 . . . parsed_2lgp 1
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61 2 . 3 . parsed_2lgp 1
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61 4 . . . parsed_2lgp 1
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or (segid " " and resid 178 and name HA) (segid " " and resid 169 and name HB1)
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or (segid " " and resid 178 and name HA) (segid " " and resid 170 and name HG1)
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;
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;
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1438
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or (segid " " and resid 170 and name HB1) (segid " " and resid 168 and name HG11)
or (segid " " and resid 170 and name HB1) (segid " " and resid 168 and name HG13)
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;
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1646
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or (segid " " and resid 123 and name HG2) (segid " " and resid 166 and name HD23)
or (segid " " and resid 123 and name HG1) (segid " " and resid 166 and name HD22)
or (segid " " and resid 123 and name HG1) (segid " " and resid 166 and name HD21)
or (segid " " and resid 123 and name HG1) (segid " " and resid 166 and name HD23)
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or (segid " " and resid 147 and name HB1) (segid " " and resid 143 and name HD13)
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or (segid " " and resid 123 and name HG2) (segid " " and resid 166 and name HD13)
or (segid " " and resid 123 and name HG1) (segid " " and resid 166 and name HD12)
or (segid " " and resid 123 and name HG1) (segid " " and resid 166 and name HD11)
or (segid " " and resid 123 and name HG1) (segid " " and resid 166 and name HD13)
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1671
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or (segid " " and resid 123 and name HB2) (segid " " and resid 166 and name HD11)
or (segid " " and resid 123 and name HB2) (segid " " and resid 166 and name HD13)
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or (segid " " and resid 123 and name HB1) (segid " " and resid 166 and name HD11)
or (segid " " and resid 123 and name HB1) (segid " " and resid 166 and name HD13)
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1697
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or (segid " " and resid 124 and name HG23) (segid " " and resid 162 and name HD2)
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1698 "w 1.000 ! spec=cnoesy, no=2283, id=2138, vol=2.124800e+01" 2671 116 2671 174 parsed_2lgp 1
1699
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assign (segid " " and resid 124 and name HG22) (segid " " and resid 162 and name HD1) 3.742 1.750 1.750 !w 1.000 ! spec=cnoesy, no=2282, id=2137, vol=2.134700e+01
or (segid " " and resid 124 and name HG21) (segid " " and resid 162 and name HD1)
or (segid " " and resid 124 and name HG23) (segid " " and resid 162 and name HD1)
;
2668 1 2670 98 parsed_2lgp 1
1700 "w 1.000 ! spec=cnoesy, no=2285, id=2140, vol=2.129000e+01" 2674 116 2674 174 parsed_2lgp 1
1701 "w 1.000 ! spec=cnoesy, no=2289, id=2144, vol=2.139600e+01" 2677 116 2677 174 parsed_2lgp 1
1702 "w 1.000 ! spec=cnoesy, no=2296, id=2151, vol=2.116400e+01" 2692 116 2692 174 parsed_2lgp 1
1703
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or (segid " " and resid 168 and name HG21) (segid " " and resid 169 and name HD*)
or (segid " " and resid 168 and name HG23) (segid " " and resid 169 and name HD*)
assign (segid " " and resid 168 and name HG22) (segid " " and resid 167 and name HD*) 3.204 1.283 1.283 !w 1.000 ! spec=cnoesy, no=2292, id=2147, vol=2.110500e+01
or (segid " " and resid 168 and name HG21) (segid " " and resid 167 and name HD*)
or (segid " " and resid 168 and name HG23) (segid " " and resid 167 and name HD*)
assign (segid " " and resid 168 and name HG22) (segid " " and resid 167 and name HE*) 3.727 1.736 1.736 !w 1.000 ! spec=cnoesy, no=2293, id=2148, vol=2.112500e+01
or (segid " " and resid 168 and name HG21) (segid " " and resid 167 and name HE*)
or (segid " " and resid 168 and name HG23) (segid " " and resid 167 and name HE*)
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or (segid " " and resid 170 and name HA) (segid " " and resid 168 and name HG11)
or (segid " " and resid 170 and name HA) (segid " " and resid 168 and name HG13)
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or (segid " " and resid 169 and name HB2) (segid " " and resid 168 and name HG13)
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or (segid " " and resid 178 and name HB1) (segid " " and resid 168 and name HG11)
or (segid " " and resid 178 and name HB1) (segid " " and resid 168 and name HG13)
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or (segid " " and resid 178 and name HB3) (segid " " and resid 168 and name HG11)
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or (segid " " and resid 165 and name HA1) (segid " " and resid 169 and name HE*)
;
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1847
;
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or (segid " " and resid 122 and name HB1) (segid " " and resid 124 and name HG22)
or (segid " " and resid 122 and name HB1) (segid " " and resid 124 and name HG21)
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or (segid " " and resid 173 and name HB2) (segid " " and resid 168 and name HG21)
or (segid " " and resid 173 and name HB2) (segid " " and resid 168 and name HG23)
or (segid " " and resid 173 and name HB1) (segid " " and resid 168 and name HG22)
or (segid " " and resid 173 and name HB1) (segid " " and resid 168 and name HG21)
or (segid " " and resid 173 and name HB1) (segid " " and resid 168 and name HG23)
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or (segid " " and resid 167 and name HA) (segid " " and resid 123 and name HG1)
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;
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or (segid " " and resid 169 and name HA) (segid " " and resid 165 and name HA2)
or (segid " " and resid 169 and name HA) (segid " " and resid 165 and name HA1)
assign (segid " " and resid 167 and name HA) (segid " " and resid 123 and name HD1) 3.314 1.373 1.373 !w 1.000 ! spec=cnoesy, no=433, id=406, vol=5.778600e+01
or (segid " " and resid 169 and name HA) (segid " " and resid 171 and name HA2)
or (segid " " and resid 169 and name HA) (segid " " and resid 171 and name HA1)
assign (segid " " and resid 167 and name HA) (segid " " and resid 166 and name HA) 2.841 1.009 1.309 !w 1.000 ! spec=cnoesy, no=434, id=407, vol=5.773300e+01
or (segid " " and resid 169 and name HA) (segid " " and resid 170 and name HA)
assign (segid " " and resid 167 and name HA) (segid " " and resid 163 and name HB2) 3.632 1.649 2.868 !w 1.000 ! spec=cnoesy, no=436, id=409, vol=5.780400e+01
or (segid " " and resid 169 and name HA) (segid " " and resid 172 and name HB2)
assign (segid " " and resid 173 and name HA) (segid " " and resid 175 and name HD2) 3.542 1.568 2.958 !w 1.000 ! spec=cnoesy, no=443, id=416, vol=5.790700e+01
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or (segid " " and resid 186 and name HA1) (segid " " and resid 202 and name HG1)
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or (segid " " and resid 165 and name HA1) (segid " " and resid 132 and name HB1)
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or (segid " " and resid 165 and name HA1) (segid " " and resid 172 and name HB2)
or (segid " " and resid 165 and name HA2) (segid " " and resid 181 and name HB2)
or (segid " " and resid 165 and name HA1) (segid " " and resid 181 and name HB2)
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or (segid " " and resid 165 and name HA2) (segid " " and resid 170 and name HG2)
or (segid " " and resid 165 and name HA2) (segid " " and resid 170 and name HG1)
or (segid " " and resid 165 and name HA1) (segid " " and resid 170 and name HG2)
or (segid " " and resid 165 and name HA1) (segid " " and resid 170 and name HG1)
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assign (segid " " and resid 163 and name HB1) (segid " " and resid 167 and name HD*) 3.018 1.138 1.138 !w 1.000 ! spec=cnoesy, no=1224, id=1160, vol=4.030200e+01
or (segid " " and resid 183 and name HB2) (segid " " and resid 181 and name HZ)
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or (segid " " and resid 167 and name HB1) (segid " " and resid 145 and name HB3)
or (segid " " and resid 167 and name HB1) (segid " " and resid 168 and name HG22)
or (segid " " and resid 167 and name HB1) (segid " " and resid 168 and name HG21)
or (segid " " and resid 167 and name HB1) (segid " " and resid 168 and name HG23)
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or (segid " " and resid 167 and name HB1) (segid " " and resid 142 and name HG2)
assign (segid " " and resid 167 and name HB2) (segid " " and resid 123 and name HB1) 3.900 1.901 1.901 !w 1.000 ! spec=cnoesy, no=1361, id=1289, vol=3.893700e+01
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or (segid " " and resid 175 and name HB2) (segid " " and resid 168 and name HG23)
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or (segid " " and resid 175 and name HB2) (segid " " and resid 168 and name HG11)
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or (segid " " and resid 170 and name HG2) (segid " " and resid 168 and name HG23)
or (segid " " and resid 170 and name HG1) (segid " " and resid 168 and name HG22)
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or (segid " " and resid 176 and name HB2) (segid " " and resid 168 and name HG21)
or (segid " " and resid 176 and name HB2) (segid " " and resid 168 and name HG23)
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or (segid " " and resid 168 and name HG21) (segid " " and resid 169 and name HD*)
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2788 "w 1.000 ! spec=nnoesyNH, no=304, id=3341, vol=1.274480e+02" 5709 116 5709 175 parsed_2lgp 1
2789 "w 1.000 ! spec=nnoesyNH, no=310, id=3345, vol=1.277160e+02" 5711 116 5711 175 parsed_2lgp 1
2790 "w 1.000 ! spec=nnoesyNH, no=320, id=3349, vol=1.286520e+02" 5714 116 5714 175 parsed_2lgp 1
2791
;
Manually assigned NOE restraints in the linker region.
FROM HCN
;
5717 1 5719 10 parsed_2lgp 1
2792 "from HCCH NOESY" 5723 1 5723 17 parsed_2lgp 1
2793 good 5724 71 5724 76 parsed_2lgp 1
2794 "assign (resid 164 and name HA) (resid 169 and name HA) 1.8 0 4.7 ! sketchy (could be to R162 HA)" 5732 1 5732 100 parsed_2lgp 1
2795
;
assign (resid 164 and name HD*) (resid 160 and name HB1) 1.8 0 4.7 ! or R162 HB1
or (resid 164 and name HD*) (resid 162 and name HB1) 1.8 0 4.7
;
5736 1 5737 70 parsed_2lgp 1
2796 "assign (resid 164 and name HD*) (resid 161 and name HB*) 1.8 0 4.7 ! new!" 5739 1 5739 77 parsed_2lgp 1
2797 "reassigned (fixed)" 5750 69 5750 89 parsed_2lgp 1
2798 good 5751 69 5751 75 parsed_2lgp 1
2799 good 5752 70 5752 76 parsed_2lgp 1
2800 good 5754 69 5754 75 parsed_2lgp 1
2801 good 5755 70 5755 76 parsed_2lgp 1
2802 good 5759 68 5759 74 parsed_2lgp 1
2803
;
good
assign (resid 166 and name HD1*) (resid 163 and name HB1) 1.8 0 4.7 !or to Y167 HB1
;
5760 70 5761 87 parsed_2lgp 1
2804 "seems ok, mirror exists but is weak." 5763 70 5763 109 parsed_2lgp 1
2805
;
good
assign (resid 166 and name HD2*) (resid 162 and name HA) 1.8 0 4.7 ! crowded region
;
5764 70 5765 87 parsed_2lgp 1
2806
;
assign (resid 168 and name HG2*) (resid 176 and name HB2) 1.8 0 4.7 ! not right! ambiguous!
assign (resid 168 and name HG1*) (resid 170 and name HA) 1.8 0 4.7 !ambiguous
;
5767 1 5768 81 parsed_2lgp 1
2807 "this one is very useful and strong" 5781 61 5781 97 parsed_2lgp 1
2808 "helps narrow linker" 5791 61 5791 81 parsed_2lgp 1
stop_
loop_
_Dist_constraint_parse_err.ID
_Dist_constraint_parse_err.Content
_Dist_constraint_parse_err.Begin_line
_Dist_constraint_parse_err.Begin_column
_Dist_constraint_parse_err.End_line
_Dist_constraint_parse_err.End_column
_Dist_constraint_parse_err.Entry_ID
_Dist_constraint_parse_err.Distance_constraint_list_ID
1
;
assign (segid " " and resid 138 and name HA) (segid " " and resid 133 and name HG1) 3.727 1.736 2.036 !w 1.000 ! spec=cnoesy, no=175, id=162, vol=6.309300e+01
or (segid " " and resid 136 and name HB1) (segid " " and resid 153 and name HG2!)
;
3805 1 3806 97 parsed_2lgp 1
stop_
save_
Contact the webmaster for help, if required. Friday, May 10, 2024 5:00:58 PM GMT (wattos1)